而这场清洗，首当其冲的便是万山安插在准噶尔内部的线人。
这些线人，是万山耗费十余年心血，一步步安插在准噶尔各部落、汗帐、军营中的，有普通牧民、有汗帐杂役、有底层军官，甚至还有几位策妄时期的边缘化官员，他们默默潜伏，为万山传递准噶尔的内部动向、兵力部署、商贸禁令，是万山在西域的“眼睛”，也是维系西域商路的关键。可这些线人的身份，大多被策妄时期的旧臣知晓，噶尔丹策零清洗旧臣时，顺藤摸瓜，将万山的线人尽数揪出，无一幸免。
短短半月，北源基地便彻底失去了伊犁方向的所有情报，安插在准噶尔内部的十七名线人，十二名被当众处决，五名被迫逃亡，不知所踪，万山耗费十余年搭建的西域情报网，几乎被连根拔起。李靖坐在北源的溶洞议事堂内，听着暗哨传回的线人遇难消息，双拳紧握，指节泛白，心中满是痛惜：“这些线人潜伏多年，九死一生，如今尽数折损，准噶尔内部的动向，我们彻底摸不清了。”
线人被清除的同时，万山在西域的商路也彻底受阻。
噶尔丹策零直接下令，封禁万山李记商号在准噶尔境内的所有商贸活动，禁止西源商队进入伊犁、乌鲁木齐等准噶尔核心城池，但凡发现万山商队的踪迹，立刻扣押物资、扣留人员。此前往来畅通的西域商路，一夜之间被彻底切断，数支正在运送物资的西源商队，在哈密以西被准噶尔骑兵拦下，满载的药材、布匹、农具被尽数扣押，商队管事据理力争，却被准噶尔士兵棍棒驱赶，险些被扣为人质，只能狼狈退回西源基地。
石敬山带着商队退回北源后，满脸愤懑地向李靖禀报：“统领，准噶尔的士兵蛮横无理，根本不提当年的密约，张口就说我们是清廷奸细，再敢越界就格杀勿论！如今西源商队别说进入准噶尔腹地，就连边境都无法靠近，我们在西域的商贸，彻底停了！”
李靖闻言，并未动怒，反而愈发冷静，他清楚，噶尔丹策零的强硬，只是开始，这位年轻新汗的野心，绝不止于封禁万山商路。他立刻召集北源核心子弟，重新梳理西域局势，又派人日夜盯防准噶尔边境的动向，很快，一个更令人担忧的消息，传回了北源基地。
准噶尔的暗哨冒死传回消息：噶尔丹策零继位后，不顾部落内老臣的反对，开始与沙俄使者频繁接触，双方在边境秘密会面，商谈结盟事宜。
噶尔丹策零深知，仅凭准噶尔一己之力，难以与清廷抗衡，为了实现自己的扩张野心，他决定引入北方沙俄势力，借沙俄的兵力与火器，制衡清廷。沙俄本就一直觊觎西域的土地与商贸，早就想染指西北边陲，如今噶尔丹策零主动示好，双方一拍即合，沙俄承诺为准噶尔提供火枪、火炮等军事物资，还答应在清廷出兵准噶尔时，从北方牵制清军；噶尔丹策零则许诺，事成之后，将准噶尔北部的部分牧场与商贸权割让给沙俄，允许沙俄商人在西域自由经商。
消息确认后，李靖连夜撰写密报，以万山最高密令，八百里加急送往辰谷基地。密报中，他详细写明策妄阿拉布坦病逝、噶尔丹策零继位、内部清洗、线人覆灭、商路受阻以及新汗联俄的全部情况，最后，他提笔写下自己的研判，字字凝重：
“策妄既死，旧约尽废，噶尔丹策零年轻气盛，野心勃勃，刚愎自用，一心与清廷为敌，又引沙俄为强援，狼子野心，昭然若揭。此人不顾西北苍生，只为一己扩张之欲，日后必成西北大患，清廷与准噶尔之间，必有一场大战。我万山西域根基受创，商路断绝，情报尽失，当早作准备，收缩防线，固守北源、西源，避免被卷入双方战事，方能保全火种。”
密报穿越千里戈壁，翻过祁连山脉，历经十余日，终于送到了湘赣幕阜山的辰谷基地。此时李毅早已从西域返回辰谷，辅佐李靖统筹全局，刘飞依旧静养，不过问具体事务，辰谷的大小事务，皆由李毅协助李靖决断。
李毅在核心书阁展开密报，一字一句看完，手中的密信缓缓放在案上，望着窗外的青山，久久不语，良久之后，才长叹一声，语气中满是惋惜与凝重：“策妄大汗在世时，虽与我们是利益合作，却也守诺十年，西域商路畅通，双方相安无事。如今策妄离世，噶尔丹策零继位，十年合作，一朝尽废，准噶尔内乱不休，又引沙俄入局，西北之事，恐将再起惊天波澜，我们在西域的日子，怕是更难了。”
一旁侍立的陈策，执掌中原情报网，闻言也眉头紧锁：“准噶尔联俄，清廷必然震怒，雍正本就对西北虎视眈眈，如今有了借口，必会出兵征讨，西北战火一起，我们的北源、西源基地，就在战火边缘，稍有不慎，便会被波及。”
李毅点了点头，走到西域舆图前，看着天山南北的版图，沉声道：“靖儿在密报中说的没错，当下之计，唯有收缩防线，固守自保。传令西域：北源基地重启最高戒备，加固防御，储备粮草物资，全员进入战时蛰伏状态，非必要不得外出；西源基地撤回所有商队，关闭边境据点，全员转移至北源，避免与准噶尔发生冲突；立刻重新搭建西域情报网，挑选精干子弟，乔装成牧民、商贩，潜伏准噶尔边境，缓慢收集情报，不可急于求成。”
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