接下来的分组搜证，张若昀作为侦探，选择和魏晨一组，搜查老陈的办公室；何炅和杨蓉一组，前往钟表店的二楼生活区；吴昕和李一桐一组，负责搜查柜台和货架区域。
老陈的办公室里，张若昀在一个上锁的书柜里找到了一个铁盒，魏晨用随身携带的瑞士军刀撬开了锁。铁盒里装着一本泛黄的账本和一沓书信。账本上记录着最近几年钟表店的收支情况，其中有几笔大额的欠款，欠款人都是同一个名字——“林曼”，还款日期正是昨天。书信则是五十年前初代老板写给老陈的，信里提到“座钟的暗格里藏着家族的秘密，绝不能让外人知道，尤其是‘林家人’”。“这个‘林曼’是谁？为什么老陈会欠她这么多钱？”张若昀皱着眉头，把账本和书信递给魏晨。
何炅和杨蓉在二楼生活区的抽屉里，发现了一个破旧的相册。相册里的照片大多是老陈和家人的合影，其中一张照片引起了杨蓉的注意：照片上是年轻的老陈和一个女人，女人怀里抱着一个婴儿，而女人的眉眼间和杨蓉有几分相似。在相册的最后一页，夹着一张纸条，上面写着：“座钟的时针在我这里，想要的话，用暗格里的东西来换——林曼”。何炅突然想起什么：“我好像听老陈提过，他年轻的时候有一个恋人，叫林曼，后来因为家族反对，分开了。”
吴昕和李一桐在柜台的暗格里，找到了一个银色的盒子。打开盒子，里面装着一枚铜制的时针，时针上的花纹和凶器分针上的花纹一模一样。李一桐看到时针，突然哭了起来：“这是我妈妈的东西！我妈妈就是林曼，她去年去世了，去世前告诉我，一定要从老陈手里拿回座钟的指针，因为那是我外公留下的遗物。”
分组搜证结束，大家回到一楼大厅集中推理。张若昀坐在侦探的位置上，目光扫过在场的所有人：“现在，我们有几个关键疑点：第一，老陈欠林曼的钱是什么原因？第二，座钟的秒针在哪里？第三，暗格里的家族秘密到底是什么？”
撒贝宁式的调侃虽未出现，但张若昀的冷静分析自带节奏。他将账本、书信、纸条和时针一一摆在桌上：“首先，从书信和照片可以看出，老陈和林曼年轻时是恋人，而林曼很可能就是初代老板提到的‘林家人’。老陈欠林曼的钱，或许和当年的分开有关，可能是老陈为了家族利益，伤害了林曼，这笔钱是补偿。”
魏晨接过话头：“其次，座钟的时针在李一桐手里，分针是凶器，那秒针一定还在店里。凶手杀害老陈，很可能就是为了找齐三根指针，打开座钟的暗格。”
杨蓉翻看着相册，突然开口：“你们看这张照片，女人怀里的婴儿，手腕上戴着一个和老陈手里一样的怀表。这个婴儿，会不会就是李一桐？”
李一桐点点头，泪水止不住地流：“是，我妈妈告诉我，老陈是我的亲生父亲。当年他为了继承钟表店，抛弃了我妈妈，我妈妈一直很恨他。她去世前，让我一定要拿回指针，打开暗格，看看里面到底藏着什么，为什么老陈宁愿抛弃我们，也要守护这个秘密。”
吴昕这时突然站起来：“昨晚我听到的争吵声，其实是老陈和李一桐的。李一桐来要时针，老陈不肯，说只要她不打暗格的主意，就把钱还给她。但李一桐不同意，两人就吵了起来。”
就在大家陷入沉思时，张若昀突然注意到老陈攥着的怀表，表盖内侧的小字虽然模糊，但能看清最后几个字：“……对不起，曼曼”。他突然想到了什么：“我们忽略了一个地方，那台古董座钟的底座！”
第二次搜证，大家直奔古董座钟。张若昀蹲下身，仔细检查座钟的底座，发现底座上有一个小小的凹槽，形状和时针、分针的末端一模一样。他将找到的时针和分针插入凹槽，底座“咔哒”一声弹开，里面藏着一个小盒子。打开盒子，里面装着一根铜制的秒针，还有一封信——是初代老板写给林曼的父亲的，信里说，当年两家因为生意竞争结下仇怨，但他和林曼的父亲其实是好朋友，为了化解矛盾，约定让下一代联姻，座钟的指针就是联姻的信物。可后来初代老板去世，老陈的母亲从中作梗，拆散了老陈和林曼，还谎称林家人要夺走钟表店。
“所以，老陈并不是故意抛弃林曼，而是被蒙在鼓里！”何炅恍然大悟，“他后来应该知道了真相，所以才会给林曼汇款，还一直守护着座钟的指针，想有一天能还给李一桐。”
就在这时，吴昕突然开口：“是我杀了老陈。”她的声音带着颤抖，“我爷爷是当年老陈母亲的管家，他告诉过我，老陈是个忘恩负义的人，是他害了林曼一家。我一直以为老陈是坏人，昨晚看到他和李一桐争吵，又看到他手里的怀表，以为他要伤害李一桐，就拿起座钟的分针，刺向了他。我真的不知道事情的真相是这样……”
真相像被拨开的迷雾，渐渐清晰。老陈的怀表在阳光下反射出微光，指针虽然停在了12:00，但那段被时间掩埋的真相，终于得以重见天日。
“明星大侦探特别篇《时间囚徒》谜案到此结束，感谢各位玩家的精彩演绎！”张若昀合上侦探手册，声音里带着一丝感慨。镜头慢慢拉远，“时光滴答”钟表店的挂钟指针缓缓转动，最终指向了正确的时间，仿佛所有的时间错乱，都在真相大白的那一刻，回归了正轨。
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