林宇决定再次派出一支突击小队，夺取指挥舰上的战略信息。这次，机械师汤姆主动要求加入，他凭借着对机械结构的精通，认为可以破坏指挥舰的防御系统，为小队开辟一条道路。医疗专家李博士也一同前往，以防队员在战斗中受伤。
当突击小队接近指挥舰时，他们发现这艘指挥舰周围有着一层特殊的隐形护盾，普通的攻击根本无法穿透。汤姆拿出自己特制的工具，开始对护盾进行分析。他发现护盾的能量频率每隔一段时间就会出现一次微弱的波动，这是护盾的一个漏洞。
他们耐心等待着波动的出现，当波动来临时，突击小队迅速行动。李博士利用自己的医疗设备干扰指挥舰的探测系统，让他们暂时无法发现突击小队的靠近。汤姆则利用工具破解指挥舰的舱门密码，在紧张的几秒钟后，舱门缓缓打开。
突击小队进入指挥舰后，遭遇了敌方士兵的激烈抵抗。汤姆利用指挥舰内部的机械装置，制造了一些陷阱，延缓了敌人的攻击。李博士在战斗中不忘自己的本职工作，时刻关注着队员们的身体状况，及时为受伤的队员提供救治。
在指挥舰的核心指挥室，他们找到了一个储存着战略信息的巨大数据库。然而，数据库有着复杂的加密系统。米莉在“星耀号”上再次接到任务，远程协助突击小队破解加密系统。她与指挥舰内部的防御程序展开了一场激烈的较量，经过一番艰苦的努力，终于成功破解了加密系统。
突击小队将战略信息成功传输回“星耀号”，林宇得到这些信息后，发现了“暗影秩序”的一个重要基地位置。这个基地是他们在这片宇宙区域的核心据点，里面储存着大量的资源和武器装备。
林宇意识到，这是一个彻底击败“暗影秩序”的绝佳机会。他决定联合艾泽尔文明以及其他星际同盟的力量，对这个基地发起一场大规模的总攻。在筹备总攻的过程中，各个文明之间因为作战计划、资源分配等问题产生了一些分歧和矛盾。
艾泽尔文明的一些将领认为应该采用大规模的能量轰炸策略，直接摧毁“暗影秩序”的基地。而地球的守护者联盟则考虑到基地内可能存在着许多无辜的生命，主张先进行劝降和疏散，然后再进行攻击。这种观念上的冲突让联盟内部出现了激烈的争论。
林宇在其中不断地协调和沟通，他理解艾泽尔文明的直接与地球的善良。他提出了一个折中的方案，先尝试用和平手段与“暗影秩序”基地内的势力进行沟通，如果遭到拒绝，再采用精准打击的方式，尽量减少无辜伤亡。
在总攻前夕，“星耀号”和其他联盟战舰缓缓驶向“暗影秩序”的基地。基地周围布满了各种防御设施，能量护盾如同一层巨大的穹顶笼罩着整个基地。当联盟舰队靠近时，基地内发射出了警告信号，要求他们立即离开。
林宇尝试用通用的宇宙语言与基地内进行沟通，表达了他们的和平意愿和对无辜生命的尊重。然而，“暗影秩序”基地内的指挥官拒绝了他们的劝降，并且发动了攻击。
联盟舰队迅速展开防御和反击。艾泽尔文明的战舰释放出强大的能量光束，如同一把把巨大的光剑刺向“暗影秩序”的基地。地球的战舰则利用引力波武器和导弹进行精准打击。
在战斗中，“暗影秩序”基地内派出了一种新型的战斗机器人。这些机器人外形酷似巨大的金属蜘蛛，它们能够在宇宙空间中快速移动，并且发射出强大的电磁脉冲攻击。这种电磁脉冲攻击对联盟战舰的电子系统造成了严重的干扰，许多战舰的导航、通讯和武器系统瞬间失灵。
林宇见状，命令精神念力者们集中力量，用精神力干扰这些战斗机器人的电磁脉冲发射装置。艾娃带领着其他精神念力者们全力以赴，他们的精神力如同一股无形的力量风暴，席卷向那些战斗机器人。在精神念力者们的努力下，战斗机器人的电磁脉冲攻击逐渐减弱。
机械师们则在战舰内部争分夺秒地修复着被干扰的电子系统。汤姆带领着他的团队，凭借着丰富的经验和精湛的技术，快速更换着受损的零件，重新编写着被破坏的程序。
科学家们在战斗中不断分析着“暗影秩序”基地的防御弱点。艾米丽通过对敌方能量护盾的监测，发现护盾在受到连续的不同频率能量攻击后，会出现短暂的能量失衡。她将这个信息迅速传达给了联盟舰队的其他战舰。
联盟舰队根据这个信息，调整了攻击策略。艾泽尔文明的战舰和地球的战舰相互配合，轮流发射出不同频率的能量攻击，对“暗影秩序”的基地护盾进行持续打击。
在经过一番艰苦的战斗后，“暗影秩序”基地的护盾终于被攻破。联盟舰队抓住机会，对基地内部进行了全面攻击。格斗家们乘坐着小型登陆艇，冲向基地内部，与敌方士兵展开了近身搏斗。
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