然而，联邦蓬勃发展引各方觊觎，“暗影联合会”残党勾结新势力“虚空幽灵团”卷土重来，目标直指“生命圣杯”与联邦核心科技。他们蛰伏于“死寂深空”，谋划突袭。联盟舰队得情报后，主动出击，驶向深空。沿途穿越“电磁风暴回廊”，智能系统引导舰队，释放反电磁脉冲，中和风暴干扰，以“生命导航图”寻隐匿路径，逼近敌巢。
敌巢位于“暗星堡垒”，周身环绕吞噬光线的暗物质云雾，防御坚如磐石。战斗伊始，“虚空幽灵团”祭出“幽灵相位炮”，炮弹可穿梭维度，突袭联邦舰队后方。舰队启用“生命矩阵战术”，护盾能量流转抵御，还击以“生命脉冲炮”扰乱敌炮相位锁定。武装机器人突击队搭乘“量子跃迁梭”，借圣杯能量突破敌巢防御薄弱处，植入病毒程序，瘫痪部分防御。
登陆小队奔赴堡垒内部，寻敌方控制中心，阻止其破解联邦科技密码。堡垒内阴森恐怖，布满陷阱，重力颠倒、激光乱射。凭借智能系统精密导航与危机预警，小队步步为营，破解机关。关键时刻，“暗影联合会”启动“末日诅咒仪式”，试图污染“生命圣杯”能量，引发宇宙局部“熵增灾难”。联邦舰队感知危机，集中火力摧毁仪式核心装置，与登陆小队里应外合，击溃敌军，再次守护联邦成果。
经此一役，联邦深知安全无小事，加固防御体系。科研部门研发“量子护盾加密网”，笼罩联邦关键区域，抵御外部入侵；智能系统升级预警模块，提前察觉危机信号，防患未然。同时，星际议会派遣外交使团，与中立文明建交，孤立敌对势力，拓展联邦影响力。
联邦未因战火停歇探索步伐，组建“星河科考队”，驶向传说中“起源星域”，探寻宇宙诞生奥秘与失落文明遗迹。沿途借助智能系统解开“时空谜题”，规避古老诅咒与危险天体，在星域深处发现“创生神殿”，殿内铭刻宇宙原初符文，记载生命与科技起源。科考队解读符文，解锁新能量运用方式、智能系统进阶算法，为联邦科技树添新枝丫，推动联邦持续向宇宙未知深处进发，续写传奇，每一步都烙印勇气、智慧与团结，于星河闪耀不朽光芒，不惧挑战，无畏前行。
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