于是就在一月二号这一天（跟前世历史中渡海的时间相近），凯撒的运输船队满载士兵离开布林迪西，顺利的度过了亚得里亚海，在伊庇鲁斯海岸登陆。
直到夜里运输船队返回时才被巡逻船发现，毕布路斯慌忙率舰队出动，只拦截下一小部分船只。
比布路斯大为恼怒，将俘虏的水手和船只全部用火烧毁，并且警告手下不得再犯同样的疏忽。
这样一来，庞培的舰队严防死守，导致凯撒的运输船队无法再运兵渡海。
已经登陆的凯撒在短期内被切断了援兵和补给线，好在船队一次性运送了近两万名士兵和几百名骑兵上岸，虽然因为船队没有空间运载足够多的粮食，但有了这支部队，他就能想办法解决问题。
凯撒聚拢登陆的军队，稍作休整，就在第二天向邻近的城镇发起进攻，在很短的时间之内就征服了伊庇鲁斯大部分地区。
接着，凯撒又准备夺取庞培军队的一个主要补给站——沿海的重要贸易港口狄拉奇乌姆。
庞培在此时已经集结好了军队，火速赶往救援，抢在凯撒之前抵达那里。
由于庞培军队有九个军团，兵力是凯撒的两倍多，凯撒不得不选择撤退。
庞培也没有选择继续进攻，因为凯撒军队兵力虽少、但是士气极其高昂，给了他极深的印象，让他感到自己的军队还需要再训练。
双方陷入了僵持，更多的通过谈判和私下的交流，试图瓦解对方。
在这个过程中，拉比埃努斯表现的最为突出，这位凯撒麾下最得力的军团长在内战爆发之后就离开了高卢，投奔了庞培。
他之所以这么做，一方面是因为庞培是他的庇主，按照罗马的传统，当庇主有需要的时候，庇户必须提供帮助；另一方面，他认为自己为凯撒征服高卢作出了重大贡献，然而大部分的荣耀都归属了凯撒，他在高卢待了七八年，却连一个执政官都没得到，他在凯撒团队中的真正价值并没有得到认可。
正是因为这些，他再次面对昔日战友时表现得异常强硬，甚至不停叫嚣着：停止任何和谈，除非把凯撒的脑袋送来，否则绝不讲和。
在这期间，一心复仇的毕布路斯积劳成疾，不久就去世了。因为种种原因，没有人被指定去接替他的舰队指挥官职务，不过舰队对海上的封锁依旧在持续。
这使得凯撒的运输船队始终无法将后继部队运送到亚得里亚海东岸，随着时间的不断流逝，凯撒自己都感到了绝望。
他开始怀疑留在意大利的部下们的信念和忠诚，认为只有自己亲自到场才能推动援军的行动，于是他乔装打扮，乘坐一艘小商船，准备前往布林迪西，结果遭遇海上劲风，被迫返回。
士兵们得知此事后，有些气愤，认为自家统帅居然如此不自信，不相信仅凭他们就能打赢战争，于是纷纷赶去恳求凯撒，对他们多一些信心，由此可见凯撒麾下士兵士气之高，以及与统帅之间的紧密联系。
双方的僵持持续到四月，马克.安东尼带领四个军团和几百名骑兵从布林迪西乘船出发，成功的在亚得里亚海东岸登陆。如果毕布路斯还在世的话，这种事情也许不可能发生，缺乏统帅的庞培舰队终究还是懈怠了。
现在凯撒手中拥有了步兵近5万，骑兵上千，虽然在数量上还是少于敌军，但他毫不迟疑的主动向庞培求战。
庞培则深知自家兵员的素质不如对方，因此拒绝与对方进行正面对抗，一面在陆地上坚守不出，一面在海上严密封锁，他相信只要切断凯撒军队的粮食供应，凯撒的这支庞大军队就会被拖垮。
凯撒也深知自身军队的这个弱点，于是决定再一次去攻占庞培军队的主要补给基地——狄拉奇乌姆。
虽然这一次他的部队先赶到狄拉奇乌姆城，但庞培军队随后赶到使他未能成功夺取该城。
凯撒随后改变策略，开始围攻庞培的军营。
凯撒开始施展他最擅长的战术之一——修筑长墙壁垒包围庞培营地，彻底切断对手的陆地支援。
庞培也不甘示弱，同样在自己营地外围修筑长墙，以保护营地。
于是，一道战争史上的奇特景象出现了：双方士兵不是在进行厮杀，而是在比赛谁建墙建得快、建得好，两道长墙如同两道平行线，围绕着庞培军营不断的延伸。
在修墙的过程中，双方也不断发生一些小的战斗，往往是凯撒的军队占据上风，毕竟他的士兵身经百战、也更勇猛顽强。
不过，随着时间的延长，凯撒军队缺乏粮食的问题越发明显，他不得不派遣不少士兵到周围地区征粮，以至于士兵们不得不吃起大麦（通常是牲口饲料），到后来连大麦有时也不一定能搞到，他们就只能将一种植物的根跟牛奶掺合，烤制成一种难吃的面包。
庞培的军队也同样遭受困难，他们的粮食倒不缺，因为可以持续从海上获得给养，但因为被围困在海岸，缺乏淡水，导致大批牲畜死亡，军营中也爆发伤病。
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