落榜的北方学子们无法接受此结果，朝中许多北方籍的官员们更纷纷抨击，要求再次选派得力官员，对考卷进行重新复核，并严查所有涉案官员。
而就在这时，有人告状说刘三吾、白信蹈暗嘱张信等人故意以陋卷进呈。
朱元璋听后大怒，五月突然下诏，指斥本次科举的主考刘三吾和副主考白蹈信等人为“蓝玉余党”，尤其是抓住了刘三吾十多年前曾上书为胡惟庸鸣冤的旧账，认定刘三吾为“反贼”，结果涉案诸官员皆受到严惩，刘三吾被发配西北。
曾质疑刘三吾的张信更惨，因他被告发说曾得到刘三吾授意，落了个凌迟处死的下场。
其余诸人也被发配流放，后来“春榜”状元陈?被株连处死，探花刘仕谔遭御史弹劾被杀，只有侍讲戴彝、榜眼尹昌隆二人免罪。此二人得免的原因，是他们在复核试卷后，开列出的中榜名单上有北方士子。
六月，朱元璋亲自策问，钦点韩克忠为状元、王恕为榜眼，焦胜为探花，是为夏榜。因所录六十一人全系北方人，故又称北榜。
想到去年株连众多官员的南北榜案，户部尚书郁新仍心有余悸，但他的身份决定了他不能不说话。
但见郁新略做沉吟，出列行礼道：“启禀陛下，臣认为科举革新势在必行，但如何革新与完善，却需细致专研，先有章程，方好参谋或实施。”
礼部尚书郑沂出列，恭声道：“臣附议。”
由于兵部尚书空置，刑部尚书夏恕与工部尚书孙显也随之出列，齐声道：“臣附议。”
朱元璋面无表情，特地望了一眼右都御史严震与左都御史暴昭，似是随意的问道：“左、右都御史如何看？”
右都御史严震沉默无言。
暴昭见严震不吱声，遂出列恭声道：“禀陛下，臣以为燕王殿下所言有理，但科举革新干系重大，甚至决定了本朝文脉之延续，臣请陛下三思。”
言罢，他屈膝跪下，以头触地，恭敬的行了一个正式且隆重的跪礼。
众臣见暴昭出言委婉的反对，心都提到了嗓子眼，生怕朱元璋一怒之下给暴昭按一个“蓝玉余党”的帽子将其诛杀。
可出人意料的是，朱元璋并没有发火，而是板着脸冷冷的问道：“左都御史有何建议？”
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