最后王世充身穿素衣，带领太子，大臣两千余人出城投降。
秦王李世民以礼相待，王世充俯身满身大汗。
秦王道：“你总觉得我是个小孩。如今你见了小孩为何如此恭敬啊？”王世充不停的叩头谢罪。
秦王李世民先让一部分人进城，维持秩序，禁止抢掠，没人敢犯禁令。
之后，秦王进入洛阳宫中，命令记室房玄龄先进入中书省和门下省，收集隋朝的地图户籍、制文诏书，但已经都被王世充销毁，没有找到什么。
然后又命令萧、窦轨等人封存了隋的仓库，没收金钱布帛，颁赐给将士们。拘押了罪行特别大的十几名王世充的同党，有段达、王隆、崔洪丹，单雄信等人。李积替单雄信求情，请秦王免他一死。秦王不允，李积大哭，单雄信道，就知道你办不成。李积道，当初我们说好了同生共死，可是我若死了，谁去照顾你的家小。最终这些人在洛水边被斩首。
秦王世民拘押了韦节、杨续、长孙安世等十几个人送往长安。老百姓没有罪而被王世充关押起来的，一律释放；被杀死的，作诔文加以祭奠。
昔日秦王府的记事杜如晦的叔叔杜奄在王世充手下做事。他和杜如晦兄弟一向不睦。害死了杜如晦的大哥，又囚禁了杜如晦的弟弟楚客。害的杜楚客差点饿死。楚客毫无怨言。平定洛阳后，杜奄论罪当诛。杜楚客哭着求杜如晦救他，杜如晦不愿意。杜楚客哭道：“叔叔已经杀了大哥，如今你又要杀了叔叔，一门之内，互相残杀，岂不令人痛心！”睡着就想刎颈而死。杜如晦没有办法，请求秦王李世民开恩，杜奄免于一死。
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