日语的起源在学术界一直有争议，在前面的章节里，笔者从文化源流的角度做出过解释。而在这一章，我们换一个角度，从学术界的认知再次总结。
明治时代的日本人因为其语法黏着、发音习惯（无流音以及元音和谐律）把日语划为阿尔泰语系，此说法已经遭到普遍否定。
近代关于日语语言分类研究，主要有以下一些观点：
1.西田龙雄（日本京都大学名誉教授，语言学家，主研古西夏语）认为日语属于汉藏语系。
2.霍默·赫尔伯特（Homer Hulbert，十九世纪末半岛传教士）和大野晋（学习院大学名誉教授，主研日本国语）认为日语属于达罗毗荼语系（参照比较语言泰米尔语）。（笔者案，可与前文介绍的盘越国历史互参）
3.白桂思（Christopher I. Beckwith，印第安那大学伯明翰分校中央欧亚研究系教授）认为日语属于日本-高句丽语系（单辟扶余语系。扶余，东北夷人也。扶余者吴也。）。
4.列昂·安吉洛·塞拉菲姆（Leon Angelo Serafim，夏威夷大学日本语专家）认为日本语言和琉球语言可以组成日本语系。
5.还有一种假设认为南岛语系、壮侗语族和日本语系可以组成南岛-台语门（Austro-Tai languages），即认为三者都有共同的起源。（缺少主流学者支持）
以昭和31年（1956年）的《例解国语辞典》为例，在日本语的语汇中，和语占36.6%、汉语占53.6%，昭和39年（1964年）日本国立研究所对90种杂志用语进行了调查研究，得出了和语占36.7%、汉语占47.5%、西洋语占近10%的结论。其中所谓的土着和语是南岛语言和阿尔泰发音方式的结合。
也就是说，日语兼有了南岛语系（越人），阿尔泰语系（东北夷）和古汉语的一些特点。虽然汉语语言的比例占到了一半左右，显然是对日本语言，尤其是文字影响最大的语种。但是我们都知道，学术从来不曾纯粹。尤其是那些西方学者，在想方设法的将日语与汉藏语系完全隔离。
事实上阿尔泰语系+今日汉藏语系，才是真正的古华夏语系。华夏族群影响力在不断向南延申的过程中，语言也与南岛语系产生了融合。汉语，日语，宇宙国语，以及一些东南亚语言，都是这种融合下产生的不同结果。
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