于是，盘古并没有善罢甘休，让九天玄女在继续研究灵气的同时，暗地里培训一支由精英组成的精锐部队。这支部队里的普通战兵都能够非常熟练地掌握灵气，被成为神兵。为了获得更强大的力量，九天玄女开始探寻从日月中汲取力量的方法，但就是这个举动，却彻底改变了世界的格局。
九天玄女经过不懈的努力，终于研究出了日月能量的秘密，但却在研究的过程中受到了某种意念的诱导，唤醒了太阳和月亮的自主意识，东皇太一和西王母由此诞生。九天玄女想要将这件事告诉盘古，却不料自己已经被东皇太一控制，自身携带的灵气反而成了一种桎梏。东皇太一掌握着天地之间，一切灵气的本源力量，只要是体内拥有纯粹灵气的个体，都会本能地听从于东皇太一的力量，而西王母则拥有改造万物的能力，能够赋予世间万物超越本我的无尽才能。
从此，一直更强悍的势力诞生了，这就是神族。盘古和他直属的精锐部队因为能够同时使用灵气和魔力，所以无法被东皇太一控制，但他麾下的其他纯粹使用灵气的军队却尽归东皇太一所有。随着东皇太一实力的增强，军队中也诞生了更多的精兵强将，制造出了三幻神这样的强神，并且直冲云霄，开辟了圣域。
盘古腹背受敌，而且这两股敌人不仅实力强悍，而且他们还拥有各自远离人间的领域，盘古则进退失据，面临着非常可怕的危险，于是，三界大战至此爆发。
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