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第四百零一章 目标RNA

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不过这也是没办法的事,庞学林到现在还与保护伞公司虚与委蛇。

要不是斯宾塞对庞学林体内的基因优化剂更感兴趣,而没再对艾丽丝下手的话,恐怕艾丽丝早就暴走了。

……

艾丽丝的这段话给了庞学林一定的压力,接下来的时间里,他将所有精力都放在了对T病毒解药的研究上面。

这下,轮到斯普鲁斯、阿什福德、柏克莱这些大佬震惊了。

庞学林之前虽然也跟着他们研究T病毒,但大部分时间他都扮演着一个助手的角色,很少会主动在学术问题上发表个人意见。

但是当他真正开始主导实验室的运行的时候,很快就展现出了一名学术大牛的实力。

实验室一共三十多人,除了庞学林、斯普鲁斯、柏克莱、黄瑜、阿什福德这几位大牛外,剩下的都是像小东北这样有一定学术背景的博士生或者研究助理。

在研究开始的前三个月。

庞学林首先让小东北他们通过冷冻电镜、原子探针层析仪、核磁共振仪等设备分析细胞内各种蛋白质以及非编码RNA的结构以及各种数据。

得到这些数据后,庞学林开始通过MOSS控制的数学方法建立蛋白质以及非编码RNA的结构与动态特征的动力学以及生物功能模型,并且让MOSS编写蛋白质与非编码RNA的模拟软件。

这项工作很繁琐,也非常复杂,但庞学林硬是凭借着自己强大的数学功底,以及量子计算机超强的计算能力完成软件的编写工作。

当他将这款软件应用到实际工作中去的时候,瞬间就把斯普鲁斯他们镇住了。

通过这款软件,科学家们可以主动构建一些全新的RNA分子以及蛋白质分子,然后通过软件模拟出这些分子的生物学功能。

结果他们很快就发现,这款软件不但模拟精度极高,甚至还可以预言一些未曾发现的蛋白质分子以及RNA分子的存在。

甚至于,庞学林利用这款软件,构建出了T病毒的生物动力学模型,完善了T病毒入侵人体的图景。

首先,T病毒通过其表面糖蛋白与宿主细胞的特异性受体结合,接着病毒囊膜与细胞浆膜(即通过不依赖于PH途径)或有酸性环境的核内体膜(PH依赖途径)融合后释放病毒核糖核蛋白复合体(RNP)至细胞浆,在转录过程中每一mRNA得以合成,而通过复制产生全长反义基因组RNA,使其作为病毒基因组RNA的模板。

新合成的RNP复合体与病毒结构蛋白在细胞浆膜或高尔基体膜组装,然后释放新合成的子代病毒。

子代病毒在细胞内生长繁殖,然后对周边的细胞发起大规模进攻。

而且,T病毒还有一个神奇的特性,它体内的RNA不仅能够利用人体正常细胞进行繁殖,甚至还可以与人体内的一些非编码RNA形成联动效应,大规模改变人体细胞的生长代谢速度。

而庞学林他们要做的,就是寻找一种能够对T病毒的RNA形成干扰的非编码RNA,从而使得T病毒陷入沉寂状态,即使感染人体,也因为基因没办法表达,从而无法在人体内大范围繁殖。

……

时间一天天流逝,不知不觉间,半年的时间转瞬即逝。

这天,庞学林刚来到实验室,负责值班的斯普鲁斯兴冲冲地找到了庞学林,大笑道:“庞教授,我们找到可以使得目标RNA了?”

“找到了,是第几组?”

庞学林眼睛一亮,有些惊喜道。

之前利用庞学林开发的那款蛋白质及RNA分子生物动力学功能模拟软件,庞学林他们编写出了一种具备使得T病毒基因陷入沉默状态的特殊RNA。

随后,他们通过对人体细胞内成千上万种RNA筛选,从中找出了两百多种RNA。

接下来,就是一组一组地实验过去。

这种工作很繁琐,基本上就是不停地重复之前的工作。

庞学林倒没有主动参与进去,他已经规划好了后续的研究路线,只等着找到目标RNA的那一天。

只是这段时间,实验室已经试验了上百种非编码RNA,始终没能达到想要的效果。

庞学林都怀疑自己之前的路是不是走错了,如果一年的约定时间到了,艾丽丝真要离开肯普滕镇,走上与保护伞公司直接对抗的道路,那庞学林真没太好的办法去阻止对方。

斯普鲁斯道:“是第112组,我们将这种RNA活性提取物注射到细胞内后,通过动态APT观察到细胞内的T病毒含量大幅度降低,甚至已经停止了RNP复合体的合成。”

庞学林点了点头,微笑道:“这是个好消息,有观察到112号非编码RNA如何实现对T病毒RNA造成基因沉默的机制吗?”

斯普鲁斯道:“我们发现,112号RNA进入细胞后,通过细胞内的RNA-蛋白质联动,可以使得组蛋白N端结构域的赖氨酸残基实现去乙酰基化加工和甲基化修饰,这一过程由甲基转移酶催化,修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰,T病毒RNA可以与经过甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质形成异染色质,在上述过程中,除了部分组蛋白的N端尾部结构域需要去乙酰化、甲基化修饰之外,有时也需要在其他的组蛋白N端尾部结构域的赖氨酸或精氨酸残基上相应地进行乙酰化修饰,这种修饰的最终结果就是T病毒相应区段的基因沉寂失去转录活性……”

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