他原是柴绍的家僮，被柴绍推荐给李渊，然后李渊又让他协助李秀宁在关中搞事，李秀宁只有几百人起家，自知实力浅薄，以游说的方式招募关中盗贼，军队扩大之后，又让机敏狡黠马三定的凭借出色的外交手段，兵不血刃的收编了李仲文、何潘仁、向善志、丘师利等部。李秀秀精通用兵之道，手上兵马一多便展开整顿、军纪严明，最后得兵七万余众，
然后在关中纵横捭阖，连败隋兵，一时威震关中，卫玄、阴世师、骨仪和屈突通等人都屡屡在他手上吃亏，从而为李渊胜利入关创造了基础。
然而李渊入主关中之后的表现实在操蛋，他不但没有封赏李秀宁，反而在第一时间夺了李秀宁的兵权，把她打发去了潼关看门，之后对她的娘子军肢解成碎片，马三宝、李仲文、何潘仁、向善志、丘师利等人也通通被轰出军队。
这是李渊本着女大不中流之观念，特地打压迟早会成为外人的李秀宁，但作为利益受损的群体，马三宝他们怎能甘心？
于是他们纷纷去找李秀宁诉苦，希望她站出来主持公道，然而不等李秀宁站出来为他们主持公道，李渊先一步把她送人了。
自此以后，马三宝和李仲文、何潘仁、向善志、丘师利通通被打发去各地当了看门狗。
如果唐朝政局稳定，满腔愤怒的马三宝也只能忍气吞声的认了，可是唐朝屡屡惨败，导致大将损失殆尽，唐朝也濒临死亡的绝境，这时候再想着重用马三宝，显然是已经迟了。
被李渊拿来交易的铺国大将军、国公，以及事成之后的郡王的承诺，只会让马三宝感到恶心。所以当李世民找他的时候，毫不犹豫就配合着李世民演了到今天，并借此机会，记下了李渊、李神通安插在军中的将校，并于今天连根拔起。
眼见造成大唐破败的罪魁祸首之一的李神通，还在叽叽歪歪的叫嚣不停，可谓是新仇旧恨一并往上涌。要不是李世民专门交待，说李神通另有用处，他恨不亲手剁了这王八蛋。
“我是李世民的叔父，马三宝你敢对我无礼？”
“现在才知道是太子的叔父，晚了。”马三宝一挥手，道：“放箭。”
“噗”
“噗”
“噗”
刹那间，箭如飞蝗，李神通的亲兵血花四溅，声声惨声响彻长空，很快被射杀一空，李神通的坐骑也被射死了，只剩下他一个人在马尸上簌簌发抖。几名士兵上前，把他牢牢的绑了起来。
马三宝踩着血迹上前，在李神通惊骇的目光中，捏住了他的鼻子，然后把一瓶药液倒入了李神通代替鼻子呼吸的嘴巴。
“你，你到底给我吃了什么东西？”被扔在地上的李神通像一条狗，又惊又怒的问道。
“你废话太多了，还是当哑巴的好。”马三宝冷冷的注视着李神通。
“啊…”李神通正要说话，却发现自己的咽喉如同被大火灼烧一般，灸热的火焰烧得他痛楚难当，在地上不住的打滚，用脑袋死死的撞击地面，企图缓解这份生不如死的疼痛。
马三宝解恨的看了李神通一眼，让人敲响了聚将鼓，自己纵身上马，向校场夺去。
“咚咚咚咚”的战鼓声很快就隆隆作响，撕破了军营的宁静。
“是聚将鼓！”
“是大将军在敲召集士兵。”
“快快，迟了要受到处罚的！”
士兵们麻利的穿上铠甲、带好兵刃，朝校场上纷纷跑去，短短一刻多的时间，北大营的唐军士兵便已经集结完毕。这些士兵今天本来也是在享受着重阳假日，但他们的主将也学起了隋朝练兵法，时不时对他们突袭一下，所以久而久之，也形成了习惯，反应得相当快。
马三宝端坐在战马上，来回打量眼前这个整整齐齐的方阵，只要将士们整齐划一，个个如同标枪一样挺拔，一股惊人气势油然而生，抛开战力不谈，这样纪律严明、反应迅速的部队，整个大唐很难再找出一支！
能有这样的军队，马三宝不得不感谢杨侗的精兵政策，几年前的各路诸侯都是“韩信”，追求兵力上数量，以人数优势给敌方造成巨大的心理威慑，然后依仗人数上的优势将对方碾碎，大家都是这一款，一旦出现大伤亡，军队就开始溃败。但是杨侗在荥阳用三万骁果大破瓦岗二十万的好处之后，便一直执行精兵强兵路线，士兵也从“闲时为农战时为兵”的半兵半农状态变成了平时专练、战时专杀的职业兵，在施行精兵政策的同时，有几千万人口为基的杨侗，还对十大军团进行大量淘汰，每一名士兵都是一级一级选拔出来的士兵，每个人都是精锐中的精锐，
现在的精兵士兵，就算面对数倍于己的半牧半兵的游牧民族，也照样占有绝对优势，军纪和作战意志更是不能比，这就是精兵政策、士兵职业化最为恐怖之处。
杨侗的精兵观念壮大自己的同时，也在影响其他诸侯，在这方面，李世民是效仿得最为彻底的人，士兵们的战力如何姑且不论，仅是以战斗意志、军纪方面来说，要是放在几年前，李世民现在几万士兵绝对可以横扫天下，只可惜时移世易，眼前这样的部队，甚至不用隋朝十大军团出手，仅是被淘汰退役的郡兵，就能把他们碾碎成粉。
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