一切的开始，要从三十年前说起。
背负血海深仇的魔术师后裔——由伍德曼、威斯考特和艾莲主持『精灵术式』仪式，卡莲在远程操作『显现装置』协助，汇集这个世界储存的魔力和灵脉，创造出被称为『精灵』的魔导生命。
这一位『精灵』的诞生，引发了一种前所未有的超大型空间爆炸，在日后被人们称之为『空间震』，这个首次发生的『空间震』造成了一亿五千多万人员伤亡，成为人类史上最惨烈的灾难。
『精灵』是四位魔术师为了向这个世界复仇而创造出来的“武器”，拥有毁天灭地的力量，只不过『精灵』的心智和初生的孩子一样，对一切懵懂无知，在四位魔术师要将她带走之时，她逃了。
『精灵』并不知道，自己并不需要逃跑，那四位魔术师，她的创造者，只是一帮掌握着超凡知识的人类，根本无法对她构成任何威胁，她甚至不费吹灰之力就能将那四人杀死。
漫无目的地四处逃跑，过程中，『精灵』无意识地引发了一次次『空间震』，这使得人类在悲痛的灾难中，认识到这种现象的危害，各国开始想办法应对，空间震预警、地下避难所、对抗精灵部队……在后来慢慢发展成熟。
最后，『精灵』的“逃亡之路”，在降临到某个岛国的城市，与一位名叫『崇宫真士』的高中少年邂逅，画上句号。
真士在爆炸的事发地，发现了一个赤身Luo体的少女，或许是出于恻隐之心，又或许是一见钟情，真士在隐约猜到这名少女不是一般人的情况下，还是将她带回家里。
不出意料的，将一个来历不明且没穿衣服的美少女带回家，真士的妹妹——『崇宫真那』，差点就要大义灭亲、打电话报警了。
真士费劲口舌解释，真那才勉为其难地相信自家哥哥没有堕入犯罪的道路，也接受了暂时留下无名少女的请求。
之后，崇宫兄妹见识到了无名少女的异常之处，刚见面时还只能发出“啊”、“唔”之类的声音，在博览群书，又从电视和收音机接收了各种信息过后，无名少女就掌握了语言体系，能够流利地说出各国语言。
这份恐怖的学习能力不只是体现在语言方面，无论是什么知识和技能，无名少女都能一学就会，样样精通，并且学习掌握的时间极短，根本不是人类能够做到的。
尽管非常震惊，但崇宫兄妹还是继续收留了无名少女，给她取了一个名字『澪』，对外介绍是亲戚，因此全名为『崇宫澪』。
无名的『精灵』，获得了『崇宫澪』之名。
之后，崇宫兄妹与澪度过了一段快乐的时光，一起生活，一起逛街，一起玩耍……甚至，真士鼓起勇气，邀请了澪一起约会，他喜欢澪，澪也在这段时间喜欢上了真士。
幸福的生活让澪忘了自己的身份，忘了有那么一群人，在锲而不舍地追寻自己，于是某一天，『D.E.M.社』——四位魔术师创立的组织，实施大规模的抓捕行动。
真那被『D.E.M.社』作为人质抓了起来，真士在带着澪逃亡的途中，不幸被威斯考特枪杀，真士的死，让澪爆发了，悲愤交加地破坏周围的一切，然后带着真士的遗体离开现场。
真士死了。
澪在崩溃边缘发了疯思考，但即使是她，也无法让人起死回生，她想过殉情，但尝试了各种自杀方式后都失败了，常规的手段根本无法将她杀死，只有与她同根同源的灵力，才能够伤到她。
不知道过了多久，澪突发奇想——如果不能复活真士，那就将真士“制造”出来！
于是，澪吸收了真士的遗体，她要让真士在自己体内重新孕育，并且融合自己的力量，这样一来，真士就能获得永恒的生命，再也不会受伤，不会被杀死。
因为人类的身体很脆弱，无法一次性吸收全部灵力，所以澪决定分批给予，起初只需要赋予『吸收灵力的能力』就行了。
“真士”顺利出世了，一如普通人类母亲那般，澪生下了“真士”，但在“真士”懂事之后，澪删除了他的记忆，并暗中促使真士高中时期的同班同学、如今结为夫妇的五河夫妇收养了“真士”，“真士”随五河家姓氏，取名为『士道』。
为了让“真士”——士道如计划那样吸收灵力，澪将自身一部分力量分裂成十颗『灵结晶』，牺牲多条人命对其进行精炼，使得『灵结晶』能够被人体安全融合后，开始选择目标，人为制造精灵。
第一个被她赐予『灵结晶』转化成精灵的是名为“本条二亚”的女性，尔后是“时崎狂三”、“冰芽四糸乃”……一个又一个少女被澪随机选中转变成精灵，被删除了作为人类时的记忆，封入『邻界』沉眠。
期间也不是没有发生意外情况，比如二亚和狂三，一个使用『嗫告篇帙』调查自己，一个使用『刻刻帝』对自己发射【十之弹】，借助各自的『天使』，她们两个找回了自己的过往，也知道澪这个“幕后黑手”。
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