对于奥斯曼帝国暂时性的在东海岸放弃军力部署，大明和欧洲列国的想法各不相同。此时的好望角仍处于荷兰人控制之下，尼德兰政府乐见奥斯曼帝国继续封锁东西方的陆上贸易通道。法兰西与土耳其人保持着功利至上的外交关系，其商人可以自由出入奥斯曼帝国的势力范围。
相比之下英格兰人就显得比较矛盾，他们急欲想赶在明朝之前独吞印度，又想占领开普殖民地，这引起了其他国家的反感。
最后是明朝的态度，朱由校知道奥斯曼帝国仍处于强盛期，应当利用他们对维也纳的垂涎来牵制欧洲，所以他一方面让西域都护府暗中与伊斯坦布尔保持军事联系，帮助他们训练新兵，赚钱巨额的军火利润；另一方面唆使郑芝龙率领波斯雇佣军在红海一带袭击奥斯曼帝国的船只，彻底将印度洋纳入大明水师的地盘。
朱由校的这些策略完全是取经于大英帝国的地缘政治，致使克伦威尔总有些既生瑜何生亮的感慨，可惜他一直被软禁在京师，对于明朝的活动只能是望洋兴叹。不过在小冰河气候的影响下，明朝面临的内部矛盾要远远大于外部压力，所以在很多国际问题上都要拉着英格兰，这也使得两国关系表面上看起来非常亲密。另外日本境内也是旱涝交替，土地近乎绝产，各藩国为了生存下去连年混战，在天灾人祸的影响下民不聊生，人口锐减，德川家光和织田信衡趁机兼并周边小国，这引起了日本总督侯峒曾的警惕，与总兵熊文灿商议后亲自前往京师面圣。
对于日本境内发生的变化，朱由校并未感到惊讶，严格来说落日行动还没有结束，经过多年的经营日本已经完全四分五裂，而德川家光和织田信衡的扩张正好给了明朝一个出兵的理由。
这些年朱由校为了稳固东瀛宣慰司的地位，一直命海军在濑户内海游弋，禁止片板下海，阻断日本的海军发展，进而控制岛内的军火贸易，收买、暗杀各类工匠，使得日本的生产力出现大幅倒退。为了完全摧毁日本的经济，朝廷命恭亲王朱由检每年从占城、暹罗、爪哇等地购买稻米，然后低价卖到日本，各地大名发现进口粮食要比自己生产划算，更加无心组织老百姓兴修水利，开垦荒地，久而久之农业也出现了荒废的情况。
从战略上讲，完全掌控了某国的粮食意味着随时可以让其出现动荡，甚至是灭亡。朱由校见德川家光和织田信衡等藩国大名不断在试探明朝的底线，心知真是“天欲其亡必令其狂”，狭隘的岛国思想一直让倭奴不知天高地厚，想想甲午战争、十四年的抗战，几千万无辜的百姓的生命，近百年的积贫积弱，时至今日其****还在大行其道，从未对侵华做出过反思。朱由校决定暂时性的放弃与欧洲列强在印度的争夺，集中优势兵力荡平日本本土，将岛上的所有居民从西伯利亚迁徙到里海和黑海之间，扶持他们在那里建立新的国家，作为黄种人在欧洲的桥头堡。
对于皇帝的决策朝中大臣并没有反对，因为明朝立国二百余年一直都在与倭寇打交道，很多人都有一笔账想跟倭人算算。比如嘉靖时期的海瑞，其父在他幼时被倭寇所杀，做官后他上骂昏君下批奸臣，唯独对那些抗倭的将士网开一面。
朱由校见内阁和军机处破天荒的全力支持自己的落日行动，当即从釜山、登莱、宁波往九州岛输送军队和战略物资，并在釜山成立前敌指挥部，由他亲自坐镇指挥实施落日行动的第三阶段，作战阵容如下：
海军方面，熊文灿麾下的长崎水师担任主攻，南居益的东海水师、毛文龙的朝鲜水师、洪承畴的南海水师以及朱由检的新港水师负责外围警戒、运输等，除了摧毁敌人的所有船只外，还要输送陆军进行一些登陆作战。
陆军方面，由戚昌国担任主帅，孙传庭、陈策、李如柏、戚昌国、曹文诏、黄得功等功勋将领在其帐下听令，另外大胆提拨了在西域作战有功的祖大寿、猛如虎、马杰等小将。
从中我们不难看出，此战朱由校准备调动士兵欲百万之众，战船三万余艘，其中海军三十万，陆军七十万，可谓倾尽举国之力来荡平日本四岛。因为需要投入的兵力过多，导致后勤的压力非常大，从这个决定开始实施到最后登岛作战，朱由校足足在乾清宫内等了两年的光景，这才如愿以偿的移师釜山。
由于日本连年内战军阀割据，明军在初期并没有遇到大规模的抵抗，但是朱由校并没有因为双方悬殊的实力而轻敌冒进，他一方面以日本王兴子的名义讨伐各地叛乱的大名，尽量拉拢那些拥戴“天皇”的旧臣和信徒；另一方面以惩治侵朝战犯为由，动员朝鲜军队参与到每一场战役当中。
面对明朝百万大军压境，德川家光并未像织田信衡那样赶紧派出使者求和，而是聚集谋士商议如何周旋到底。要说这个德川家光的确是个奇才，称得上是一位比较有作为的幕府将军。他掌权后立即对幕府进行了大刀阔斧的改革，确立了他的绝对权力，同时颁布《宽永令》，确认了奉公权，对于地方大名和武士进行严格的控制和培养。另外，他为了阻止贩奴运动和天主教的传播，坚持推行闭关锁国的政策，将传教士全部赶出境内，并中断了与欧洲的一切贸易往来。
后水尾天皇禅位后，他表面上承认明朝皇帝将天皇降为日本王的决定，按时到长崎朝拜兴子，暗地里却怂恿那些“保皇派”对抗明朝，同时重金收买东瀛宣慰司的官员，购置大量的火器壮大自身的力量。随着实力的一步步增强，他巧借天灾吞并周边的小国，占领北海道以后秘密修建造船厂，聘请西洋工匠建造大量的新型战船，企图用武力将明朝赶出九州岛，重新统一日本。
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