首当其冲的就是大蛇丸，第一个登场的BOSS，剧情里交代的也很清楚，他就是一个为了自己达到长生而丧心病狂的人，沉迷于研究禁术根本不把人命当回事，终于被老师三代火影发现了，可时他毕竟是三代最心爱的弟子没有忍心杀他，在当年放过了他，致使三代晚年时大蛇丸杀到木叶来，已经通过夺取他人身体的方式间接打成永生，还不住嘲笑老师已经老了。大蛇丸出现在忍者考试中，让火影忍者的剧情第一次有了大的波动，也是鸣人和佐助分分合合恩恩怨怨的起因，就是大蛇丸把佐助拐跑的。
第二个就是宇智波鼬，肯定会有人说他是有苦衷的，其实他是正义的，别忘了大部分时间他都是在和木叶作对，并且为晓组织办事，岸本总是喜欢在收尾时把一些角色洗白，宇智波鼬也还算是合乎逻辑些，可总是在最后阶段才白了说服力不够，全按照岸本的来，那么大蛇丸、团藏、佩恩、宇智波斑、带土、辉夜姬都是白的，那谁是黑的呢？打败他们的鸣人和佐助吗？
团藏姑且算坐是反派吧，更多的是一个恶心人的存在，木叶有难做缩头乌龟，关键时刻夺权，没有他的存在，三代和四代火影在位时应该都会省心不少。佩恩不是出自木叶村，可是也与木叶村有很深的瓜葛，他的轮回眼是带土给的，他的本领是自来也教的，名义上还是鸣人的师兄，就这么一个人把木叶村夷为平地，几乎把村里人都杀了，幸好鸣人嘴遁厉害，他又会一招全体复活。
带土和斑不但出自木叶村，还都是宇智波一族，为何没把鼬和他两放在一起呢，鼬神神秘秘的却也没有大动作，这两人却野心巨大，要把整个忍界都霍乱起来，还就让他们成功了，整个火影忍者从头到尾的剧情都是这两位引起的，斑是策划者，带土是执行者，他两人一死全世界立时就太平了十几年。
要问为何都出自木叶村，理由再简单不够，谁让这部动漫叫做火影忍者呢，要是叫做风影忍者兴许强大反派就都跟沙隐村有瓜葛了，再说了主角鸣人和佐助都是木叶村出身，反派不来木叶闹事，怎么讲他两人的故事呢？反派是外村的显不出木叶强大，都是村里人正好是一部内斗剧，整篇火影讲的就是徒弟杀师父，窝里斗的故事。
团藏是一个非常特殊的角色。在三代火影就任的期间，团藏曾使用各种办法来为木叶获取利益，但是最终却没有成为他想要的样子。如果团藏当时替代了三代火影，木叶之后会是怎样呢？
团藏与猿飞两个人的性格是完全不同的，如果团藏当上了火影，那么在木叶村中最先遭殃的肯定就是宇智波一族。因为他深受二代火影的影响，心里也非常憎恨宇智波族人。
如果这样的话，那么宇智波的政变会提前到大蛇丸进攻木叶之前发动。这个时候很有可能出现伤敌一千自损八百的后果，到那个时候其他村子对木叶就有机可乘了。
还有一点最重要的是团藏没有领导能力和仁爱之心，他除了自身的利益之外根本考虑不到其他事情。所以他很有可能因为自己的想法而导致木叶村走向歧途。
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为了坐稳火影的位置很有可能将水门这种天才忍者所埋没，水门一旦被埋没很有可能导致他没有办法遇到玖辛奈，所以鸣人就应该不会出生。这一系列的后果，都是团藏当上火影后有可能出现的。
自来也独特的血继限界，能将身体隐形，打佩恩的时候怎么不用？在动漫火影忍者中自来也的死对很多漫迷是一个不小的打击，很多人疑惑当时自来也和佩恩交手的时候为什么那么拼，难道不知道进退有度吗？或许你会说自来也伤势太重了，没办法逃走，其实并不是这样，自来也有一种血继限界，可以完美的躲过敌人的追杀！
还记得当时和佩恩交手自来也使用了不少消耗特别大的忍术仙术，当时小编就觉得不对劲，自来也虽然开启仙人模式后才有爆发，但是普通状态下的自来也大可以使用低消耗的法术先探底，而不是上来把所有忍术都交了，最后只能挨打，更让人想不明白的是，自来也掌握了血继限界也没有使用！
或许很多人不知道自来也的血继限界是什么，其实在自来也的回忆里曾经提到到，当时三代和自来也纲手大蛇丸玩老把戏抢铃铛，自来也被绑在了树上，而自来也也说出了自己其实还有血继限界没有使用，那就是透遁！这个血继限界可以将身体隐藏，就算是牙的忍犬也没办法闻出味道。
虽然自来也在动漫中没有使用过这个忍术，但是月光疾风在被秽土转生复活后使用了透遁，这让小樱也措手不及，这招可以完全的隐藏自己的形体，就像是我们通常说的隐身一样，透遁的能力如果用在暗杀忍者身上，可以说是锦上添花了。
那么自来也在很小的时候就学会了这个忍术，为什么在和佩恩交手的时候没有使用呢？如果当时自来也使用了透遁潜入了雨忍村不仅可以拿到手情报，还可以全身而退，但是自来也却选择了最冒险的方式，就算是被发现，受了伤。自来也也可以使用透遁隐藏气息逃走，难道这个血继限界还有什么特殊的条件才可以发动吗？
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