其实詹姆斯一直认为他和史蒂夫之间的理念没有分歧。史蒂夫想要为更好的美国而奋斗，巴基也是一样，他在为人类更好的未来而努力，用自己的方式——尽管那在史蒂夫看来无法接受。
和巴基一样，史蒂夫在战后的美国军队里也逐渐获得了越来越高的头衔。他们两个之间偶尔有书信往来，史蒂夫和以前一样，很不合群，他也看不惯那些政客和一些高级将领的行为，他选择去训练士兵，为美国实打实的做实事儿，远离那些他讨人厌的上层们。
巴基觉得史蒂夫也意识到那些凌驾于普通人之上的‘国家精英们’都是毒瘤，可是史蒂夫不会承认。
后来，史蒂夫离开了部队，他组建了一个特别行动组织，战略科学军团——那是神盾局的前身。史蒂夫绝对是在帮助巴基收缴九头蛇势力的那段时间里也学习到了九头蛇的组织模式，史蒂夫也同样拥有着极其出色的战略才能，只是总不愿意使用。
两个组织的定位都很超前，所以他们在后来的十年里总是会在资源和人员上面有一些争锋出现，最争锋相对的一次，亲自出任务的詹姆斯遇到了同样预料到他会来所以前来等候的史蒂夫。
在一个夜晚，某个城市的屋顶，巴基手里拿着装有重要物质的手提箱，而史蒂夫在另一头注视着他，手里的枪对着巴基。
“你这样做是不对的。”史蒂夫轻轻说，“我认识的那个巴基善良、心软、赤诚之心。他不会做这样的事情。”
“你说得对，史蒂夫。我变了。我已经为祖国死了一次，我现在不欠任何人的了。”詹姆斯道，“从小到大，你一直比我意志坚定，有自己的主见，所以我总是被你影响，听你的。可是那次死里逃生让我看清了这世界的本质，我们太渺小了，史蒂夫，仅靠我们两人，没办法保护所有人。”
“所以你宁可被所有国家通缉，与全世界为敌，也要拿到所有你想要的资源？”
“我没有伤害过任何人。”巴基说，“如果你觉得我是最大恶极的，那就杀了我吧。我不会退让一步的，我会得到我所想要的一切东西。而我这是在救你的命。”
“你在说些什么？”史蒂夫皱起眉毛。
“你我都是那批注射血清的士兵之中最成功也是最强大的，在你之后，美军里再也没有人能够比你更强大。”巴基平静地说，“他们现在信任你、崇拜你，可总有一天他们会开始嫉妒你，对你起疑心，处处防备，处处限制。如果有这么一天，我会救你的。”
史蒂夫注视着他，轻轻呼吸着，疲惫又无可奈何。
“巴基，你所说的一切我都知道，也有所准备，可是解决办法不应该只有这样极端的方式。”他说，“那些高危资源也不应该握在单一组织的手里，九头蛇手中的东西太多了，这不应该。”
詹姆斯叹了口气，他握着手提箱，另一只手揣在兜里，站在楼房的边缘，远远地注视着史蒂夫。他的神情是和过去一样的柔软温和，可是眼眸中却闪烁着坚定的火焰。
“你说得对，我们之间的理念已经不同了。”巴基轻轻地说，“可你又能怎么样呢？”
史蒂夫愣住了，在他黑洞洞的枪口之下，詹姆斯翻身从楼顶跳下，轻盈得像是夜幕下的一头小鹿，根本不担心史蒂夫是否会开枪。紧接着一座直升机腾空而起，逐渐远去。
从那之后，他们两个之间的关系似乎变得似敌似友起来，他们之间不再互通书信了。巴基在九头蛇里紧密地研究新型武器和血清，只不过武器进展很快，血清却没有什么成效。
他卧底在美国高层的特工报回信息——战略科学军团在血清的研究效果下突飞猛进，据说是一个叫做霍华德·斯塔克的加盟了他们，又过了一年，他们研发出了强性血清，可惜除了拥有超凡体质的史蒂夫来说，没有人能够承受住这样的痛苦。
与此同时，巴基意识到九头蛇给他注射的血清要次史蒂夫的血清一等，他们都比普通人长寿，但却没有那么大的区别。从强性血清研发出来的那一年开始，詹姆斯每过五年就能收到史蒂夫的一箱血清，原来只要每五年注射血清，就可以一直将身体保持在最强壮的年华，并且补全战力。
后来又发生了很多事情，地球一片混乱，变种人和人类的矛盾爆发，还有人类政府和超级人类之间的矛盾……地球越来越乱，战争频发，詹姆斯看到身处于矛盾中心点的史蒂夫越来越被动。
可是他没有办法，他和史蒂夫之间没有任何矛盾，只不过他们拥有着无法劝服对方的不同理念，所以才占据不同的阵营。他们仍然是最好的朋友，也仍然互相信任。可是詹姆斯无法将史蒂夫从漩涡中心拽出来，因为男人那该死的正直的信念感。
巴基逐渐接触到了一些志同道合的朋友，比如霍华德的儿子托尼·斯塔克，一个天生孤傲聪明的人，他和詹姆斯观点相同。托尼甚至比霍华德还要聪明天才，他召集了同样受够了这狗屎一样的世界的超级人类们，这些年来被边缘化的超能力者们的反击开始了。
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