新生代期间，神农架地区的山脉继续受到地壳抬升的影响，同时，雨水、河流等自然力量的侵蚀作用，使得山脉逐渐呈现出今天的地貌特征。
生态系统的保存特色，远离尘嚣的天然屏障，神农架地区由于其地理位置的偏远，加之周围山地的阻隔，使得这里相对较少受到人类活动的干扰。这种天然的屏障，为生态系统的保存提供了有利条件。
神农架的生态系统因其原始性和完整性而闻名。这里生活着众多珍稀动植物，如金丝猴、大熊猫、羚牛、红豆杉等，它们构成了一个复杂而稳定的生物链。
神农架的生态系统具有较强的自我修复能力。这里的森林、土壤、水源等自然要素，能够在一个相对封闭的环境中实现物质循环和能量流动，维持生态平衡。
神农架地区的地质形成与生态系统的保存是相互影响、相互促进的。地质构造为生态提供了多样的栖息地，而生态系统的稳定又反作用于地质环境，减少了水土流失，保护了地质遗迹。
神农架地区的地理形成是一部自然力量的杰作，它不仅展现了地球的演变历程，也为人类提供了一个研究地质历史和生态系统的天然实验室。
神农架因其独特的地理位置和相对封闭的自然环境，保存了丰富的生物多样性，拥有许多珍稀和特有的动植物种类，在神农架发现的珍稀动植物。
1、珍稀动物
（1）金丝猴：金丝猴是中国特有的珍稀灵长类动物，也是国家一级保护动物。神农架是其主要栖息地之一。
（2）大熊猫：虽然大熊猫主要分布在四川、陕西和甘肃，但神农架也有少量大熊猫的分布。
（3）朱鹮：朱鹮是一种极度濒危的鸟类，曾被认为在野外灭绝，但后来在陕西和神农架等地重新发现。
（4）羚牛：羚牛是国家一级保护动物，也是神农架地区的大型哺乳动物之一。
（5）云豹：云豹是一种体型较小的豹类，属于国家一级保护动物，在神农架有分布。
（6）红腹锦鸡：红腹锦鸡是国家二级保护动物，以其艳丽的羽毛而着名。
（7）白颊长臂猿：这是一种珍稀的长臂猿，属于国家一级保护动物。
2、 珍稀植物
（1）水杉：水杉是一种古老而珍稀的植物，被誉为“活化石”，在神农架有自然分布。
（2）红豆杉：红豆杉含有抗癌成分紫杉醇，是国家一级保护植物。
（3）珙桐：珙桐又称“中国鸽子树”，是国家一级保护植物，因其花朵形似白鸽而得名。
（4）连香树：连香树是一种特有的落叶乔木，属于国家二级保护植物。
（5）银杏：银杏也是一种古老的植物，被称为“活化石”，在神农架有分布。
（6）各种兰科植物：神农架拥有丰富的兰科植物资源，其中许多种类都是珍稀的。
这些珍稀动植物种类反映了神农架生态系统的独特性和重要性，因此该地区得到了国家和地方政府的高度保护。
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