强盗们见苏瑶孤身一人，便想抢夺她的药材。苏瑶奋力反抗，与强盗们展开了一场激烈的搏斗。她虽然学过一些防身术，但面对众多强盗，仍渐渐处于下风。就在她绝望之时，阿福带着一群村民赶来支援。原来，阿福见苏瑶久久未归，担心她的安危，便四处寻找，最终找到了这里。
在众人的帮助下，苏瑶成功击退了强盗，带着药材回到了医馆。回到医馆后，苏瑶立刻投入到解药的研制中。然而，新的问题出现了，药材经过一路的颠簸，部分已经受损，影响了药效的发挥。苏瑶心急如焚，她再次仔细查阅古籍，尝试寻找替代的方法。
同时，城中一些达官贵人听闻苏瑶在研制解药，便派人来施压，要求先为他们的家人提供解药，全然不顾普通百姓的死活。苏瑶坚决拒绝，与这些权贵据理力争，这也引来了他们的记恨，暗中派人破坏她的研究，偷走了一些关键的药材。
祸不单行，医馆里突然爆发了一场莫名的火灾，虽然火势及时被扑灭，但不少药材和研究资料都被烧毁。苏瑶怀疑是那些权贵所为，却没有证据。她强忍着愤怒和悲痛，重新整理剩下的资料和药材。
为了获取更多药材，苏瑶想起了之前救她的猎户，便前去求助。猎户被她的坚持打动，召集了一些同行，组成采药队，深入更偏远的山林为她寻找药材。在采药队出发期间，苏瑶一边安抚着医馆里的患者，一边继续研究那些残缺不全的资料。
不久后，采药队满载而归，但带来的药材中有一部分因保存不当，出现了变质的迹象。苏瑶没有气馁，她利用所学知识，尝试对这些变质药材进行处理，看是否还能使用。经过反复试验，她成功挽救了部分药材。
在研究过程中，苏瑶发现古籍中记载的一种药材与山谷药田中的某种植物极为相似，但存在细微差别。她大胆推测，这种植物或许可以作为替代药材。为了验证这个想法，她再次前往山谷，这一次阿福也执意同行。
在山谷中，他们遭遇了山体滑坡，滚落的巨石挡住了他们的去路。两人艰难地攀爬，寻找其他路径，终于找到了那片植物生长的区域。经过仔细辨认和采集，他们带着新发现的药材回到医馆。
然而，当苏瑶将新药材融入配方进行试验时，却引发了患者的不良反应。一时间，医馆里人心惶惶，患者家属们纷纷指责苏瑶。苏瑶顶着巨大的压力，仔细检查每一个环节，终于发现是药材的炮制方法有误。她调整了炮制方法后，再次进行试验，效果显着改善。
随着研究进入关键阶段，苏瑶发现需要一种特殊的泉水来调和药材，才能发挥最佳效果。她四处打听，得知这泉水位于一座险峻的山顶。苏瑶毫不犹豫地踏上了寻找泉水的征程。在爬山过程中，她遭遇了狂风和暴雨，山路湿滑，好几次险些失足坠落。
终于，她找到了那处泉水，装满了容器。在返回医馆的途中，她又遇到了一群野狼的袭击。苏瑶挥舞着手中的木棍，与野狼周旋，身上多处受伤。就在她体力不支时，采药队的猎户们再次出现，赶走了野狼，护送她回到医馆。
回到医馆后，苏瑶马不停蹄地投入到解药的最终研制中。
此时，疫病再次突变，原本接近成功的解药配方对新变种毫无作用。苏瑶把自己关在药房，对着堆积如山的医书和试验记录，逐行逐字地筛查，不放过任何一个可能的线索。她不仅重新分析古籍中那些被忽视的偏方，还尝试将现代医学理念与古代药理知识结合，在一次次失败中，不断调整药材配比和药理分析思路。每一次新的尝试都伴随着巨大风险，稍有差池就会浪费珍贵药材，但她咬牙坚持，日夜连轴转，眼睛布满血丝，整个人瘦了一圈。
城中突然传出谣言，说苏瑶是妖女，故意研制假解药来祸害百姓，只为谋取私利。谣言迅速传开，不明真相的百姓对医馆充满敌意，甚至有人前来砸医馆。苏瑶不得不暂时放下研究，与阿福和郎中们一起应对。她组织郎中在医馆门口现场演示药材甄别和药方制作，邀请城中有威望的老者见证，同时让阿福跑遍大街小巷，挨家挨户寻找曾被救治好转的患者。阿福历经艰辛，终于找到几位愿意为苏瑶发声的患者，在他们的帮助下，这场风波才逐渐平息。
医馆里一位资深郎中一直对苏瑶的研究方式不满，觉得太过冒险。关键时刻，这位郎中联合几个助手集体辞职，还带走不少重要研究思路和部分药材。苏瑶只能重新招募学徒，亲自从药材辨认、炮制教起，详细讲解药方原理。她发动阿福和留下的郎中，凭借记忆与残留资料，重新梳理被带走的研究思路。同时，她穿梭于各个药材市场，不放过任何渠道，与药商讨价还价，甚至前往偏远村落向草药人请教，历经波折，终于找到勉强能替代的药材，为研究争取了一线生机。
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