然而，他们的研究还未完成，宇宙联盟总部就传来了紧急消息。情报部门发现，一股神秘势力正在暗中集结，似乎准备对宇宙联盟发动大规模的攻击。这股神秘势力的来源和目的都不清楚，但从收集到的情报来看，他们拥有强大的科技和军事力量，不容小觑。
杰克得知消息后，立刻命令探索队返回宇宙联盟总部。同时，他召集各部门负责人，商讨应对策略。军事部门的卡尔将军建议加强联盟的防御力量，同时派遣侦察舰队去探查神秘势力的动向。科研部门则表示，他们将全力研究从远古遗迹中获取的信息，试图找到对抗神秘势力的方法。
探索队在返回途中，遭遇了神秘势力的拦截。一支装备精良的舰队突然出现在他们的航线上，将他们团团围住。亚历克斯命令飞船进入战斗状态，同时试图与对方进行通讯，但对方没有任何回应，直接发动了攻击。
战斗一触即发，探索队的飞船在敌人的猛烈攻击下，多处受损。亚历克斯冷静地指挥着船员们进行反击，利用飞船的机动性和先进武器，与敌人展开周旋。在激烈的战斗中，探索队发现敌人的战舰似乎采用了一种新型的能量护盾，普通的武器攻击对其效果甚微。
关键时刻，科研人员们根据在远古遗迹中获得的能量知识，对飞船的武器系统进行了紧急改装。他们成功调整了武器的能量频率，使其能够穿透敌人的能量护盾。经过一番苦战，探索队终于成功突破了敌人的拦截，安全返回了宇宙联盟总部。
回到总部后，探索队将在远古遗迹的发现和遭遇神秘势力拦截的情况详细汇报给了杰克。杰克意识到，这股神秘势力与远古遗迹之间可能存在着某种联系。他决定成立一个联合调查组，由情报部门、科研部门和军事部门共同参与，深入调查神秘势力的来历和目的。
在调查过程中，他们发现神秘势力的首领是一个来自古老文明的幸存者。这个古老文明曾经与宇宙联盟发生过冲突，被击败后一直怀恨在心。经过多年的蛰伏，他们终于积蓄了足够的力量，企图对宇宙联盟进行报复。而他们盯上远古遗迹，是因为他们知道遗迹中隐藏着能够摧毁宇宙联盟的强大武器。
杰克得知真相后，立刻制定了应对计划。军事部门迅速集结舰队，准备主动出击，摧毁神秘势力的基地。科研部门则在加紧研究远古遗迹的科技，试图找到破解神秘势力武器的方法。
在战斗打响前，杰克对全体参战人员进行了战前动员：“我们面临着前所未有的挑战，但我们是宇宙联盟，我们有勇气、有实力保卫我们的家园。这一战，我们必须胜利！”
随着一声令下，宇宙联盟的舰队浩浩荡荡地向着神秘势力的基地进发。一场决定宇宙命运的大战，即将拉开帷幕……
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