面对神秘黑暗物质，舰队尝试了各种攻击与防御手段。他们使用能量武器试图摧毁黑暗物质，但发现黑暗物质能够吸收能量并变得更加强大。他们又尝试用引力装置将黑暗物质牵引到远离文明区域的地方，却发现黑暗物质的引力异常强大，反而对舰队自身造成了威胁。
在不断的尝试与失败中，舰队的科学家们开始深入研究黑暗物质的本质。他们发现，黑暗物质并非普通的物质形态，而是一种与宇宙负面情绪和混乱能量相关的实体化表现。它的出现可能是由于宇宙中众多文明在发展过程中积累的负面因素，如战争、贪婪、仇恨等，汇聚而成。
为了对抗黑暗物质，舰队提出了一个大胆的计划。他们决定利用联盟与星灵族在之前探索中对宇宙意识和能量核心的研究成果，尝试将正面的宇宙能量，如爱、希望、团结等情感能量转化为一种可攻击的力量，来中和黑暗物质的负面能量。
这一计划需要全体舰队成员以及各个文明的共同参与。他们通过一种特殊的心灵连接装置，将每个个体的正面情感汇聚起来，然后由科学家们运用科技手段将这些情感能量转化为能量波，发射向黑暗物质。
在实施过程中，困难重重。许多个体难以完全释放自己内心的正面情感，需要进行大量的心理辅导和精神训练。而且，情感能量的汇聚和转化过程也面临着技术上的挑战，时常出现能量不稳定和泄漏的情况。
但是，在面对整个宇宙的危机面前，各个文明的成员们克服了自身的困难。他们放下了彼此之间的隔阂与矛盾，全心全意地投入到这场拯救宇宙的战斗中。
随着越来越多的正面情感能量被汇聚和转化，黑暗物质的蔓延速度逐渐减缓。在一场惊心动魄的最终决战中，宇宙维和舰队将凝聚了所有文明正面情感的强大能量波发射向黑暗物质的核心。在耀眼的光芒中，黑暗物质开始逐渐消散，被吞噬的文明区域开始逐渐恢复生机。
这场战斗让联盟与星灵族以及整个宇宙的文明深刻认识到，宇宙的命运与每个文明的发展息息相关。只有秉持着积极向上、和谐共生的文明发展理念，才能够在宇宙的漫长历程中生存与发展。在危机过后，宇宙文明联盟正式成立，各个文明在联盟的框架下共同制定了一系列保护宇宙生态平衡、促进文明交流与发展的规则与制度。联盟与星灵族也继续在宇宙探索的道路上前行，他们带着对宇宙更深的敬畏之心，不断探索宇宙的奥秘，为宇宙的和平与繁荣贡献自己的力量，而那与宇宙意识相连的能量核心，依然静静地悬浮在宇宙边缘，成为了宇宙文明永远的警示与探索目标。
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