主要为留鸟，部分在长江以北地区繁殖的种群为夏候鸟，冬季迁到南方越冬。
冬季主要栖息在海拔1000米以下的低山丘陵和山脚平原地带的树林中，夏季可上到海拔1000-2000米，有的地方甚至进到海拔2500-3000米的中高山地带，垂直迁徙现象极明显。
通常生活在次生林、阔叶林、常绿阔叶林和针阔叶混交林及其林缘地带，冬季有时也出现在疏林荒坡、路边或地头树上。
而黑短脚鹎因为习性所以常单独或成小群活动，不过有时也集成大群，特别是冬季，集群有时达100只以上，偶尔也见和黄臀鹎混群。
性格较活泼，常在树冠上来回不停地飞翔，有时也在树枝间跳来跳去，或站于枝头。
偶尔也见栖立于电线上，不过很少到地上活动，善长鸣叫，有时站在树顶梢鸣叫，有时成群边飞边鸣，鸣声粗厉，单调而多变，显得较为嘈杂。
食物的话主要以昆虫等动物性食物为食，不过也吃植物果实、种子等植物性食物，属于杂食性鸟类。
而动物性的食物主要有蜂、天牛、象甲、甲虫、蝗虫、蚂蚁、蝽象等鞘翅目、膜翅目、直翅目、鳞翅目等昆虫和昆虫幼虫。
植物性食物则主要为浆果、榕树果、乌桕种子等。
另外黑短脚鹎已经被列入中国国家林业局2000年8月1日发布的《国家保护的有益的或者有重要经济、科学研究价值的陆生野生动物名录》，也就是我们俗称的三有里面。
所以大家遇见了长点心眼哈，别乱打鸟。”
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