佛告阿难：“汝今已得须陀洹果，已灭三界众生世间见所断惑，然犹未知，根中积生无始虚习，彼习要因修所断得。何况此中，生住异灭，分齐头数？
这个地方就说明，身为阿难尊者，你为什么要选择六根？因为你非选择不可，因为你有法执嘛。佛告阿难，说你现在已经证得了小乘见道位的初果，初果当然就不入色声香味触法了，对于六尘的粗的分别已经不生起了。因为他不入色声香味触法，所以他灭除了三界的有情众生当中的一个“见所断惑”，三界的见惑已经断除了，也证得了无我的真理。但是俱生的我执，这个微细的我执还是存在的，所以仍然没有能够完全了知在六根当中所累积的无始以来这种虚妄的习气，这个就是所谓的思惑。这个思惑要到修道位才能够慢慢地断除。他的我执未尽，就是破了分别我执，俱生我执还在。
更何况在六根当中那种微细的“生住异灭”。我们烦恼有四种相貌：生、住、异、灭。这种种产生的“分齐头数”，包括了我们讲“一念不觉生三细，境界为缘长六粗”，一念的妄动产生了三细六粗，这种种的差别相状，那更难掌控。
佛陀诃责阿难尊者“法执犹在”，意思就是说，为什么要选择六根呢？因为我们的确有法执啊。有法执的话，每一个根对我们的效果的确不同，因为我们不能够法法自在。所以凡位的众生的确要选择六根，这个在事相上你必须要拣别的。
这以下佛陀就把这六根的关系详细地说明。
今汝且观，现前六根，为一为六？阿难！若言一者，耳何不见？目何不闻？头奚不履？足奚无语？
先提出一个问。说你现在姑且去观察，你现前身心世界的六根门头，到底是一还是六？“一”的话就完全相同。如果是“一”的话，那你选择哪一根都一样了。如果选择“六”，那么六根完全不同。六根完全不同那就糟糕了。六根完全不同，那你断了耳根的烦恼，你还得去断眼根的烦恼，还要断意根的烦恼，因为它六根完全不同。所以，到底它是完全相同，还是完全不同，这个要拣别出来。
我们先看“非一”的情况。“阿难！若言一者”，假设六根的功能是完全相同的，那么“耳何不见”？你耳朵为什么不能见东西呢？眼睛为什么不能去听声音呢？头部为什么不能走路呢？双脚为什么不能说话呢？可见得，六根的作用的确是有它的各别独立的体性的。既然有它的各别独立体性，当然要再拣别了，因为它“非一”嘛。
看“非六”。
若此六根决定成六，如我今会，与汝宣扬微妙法门，汝之六根谁来领受？阿难言：我用耳闻。佛言：汝耳自闻，何关身口？口来问义，身起钦承。
但是它也不是完全的“六”，它也不是完全不同。假设六根是决定成六，是各各不同，那各各不同就糟糕了。六根是完全独立，那我们修行就要修六次，耳根圆通修完，还要修眼根圆通乃至意根圆通，因为它完全独立。所以它不能说是完全不同。
比方说，我们在楞严法会当中，佛陀为汝等众生来宣扬首楞严王大定的微妙法门，那么阿难尊者你六根当中是用哪一根来领受佛陀的法音呢？阿难说，我是用耳根来听闻佛陀的法音。佛陀说，你用耳朵来听佛陀的法音，那跟你的身业、口业——身、口二根有什么关系呢？你为什么耳根听了法音以后，你会用嘴巴来问问题，身体会感到很恭敬，起来跟佛陀顶礼呢？因为你是用耳根听，就算你感动，你有很多的感觉、想法，也应该是在耳根里面活动，怎么会跑到身根、跑到口业去了呢？你那个声音是从耳朵进去的，怎么到最后嘴巴也开始动作了，身体也开始动作了？可见得六根的确是有它相通之处。所以说，声音是从耳根进去，但是它表达出来却是身口意六根的活动，所以你不能够说六根是完全独立的。
所以作总结。
是故应知，非一终六，非六终一，终不汝根元一元六。阿难当知！是根非一非六，由无始来颠倒沦替，故于圆湛一六义生。汝须陀洹，虽得六销，犹未亡一。
六根的相互关系，这以下作一个总结：它是“非一终六，非六终一”。从功能上来说，它不是一而是六。这个“终”就是毕竟，它毕竟是六。因为“用中相背”，前面说过，在作用上的确是有它的差别，但是“非六终一”，从体性上来说它却是一而不是六，因为它“性中相知”。所以，我们终究不能够说这个六根决定是一或者决定是六。所以阿难当知，这个六根它非一，因为它“用中相背”；非六，因为它“性中相知”。
那么这六根怎么来的呢？是我们无始劫来因为颠倒的妄想而沦落于生死，所以把这个圆满湛然不动的清净本性虚妄产生了一跟六的差别，我们讲“元依一精明，分成六和合”。所以，虽然阿难尊者证得须陀洹果，已经能够“六销”，就是对六尘不再生起粗的分别，所谓不入色声香味触法，但是“犹未亡一”，对于六根门头当中妄想的结使还没有真正地消除，还没有回归到一念心性。
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