人类最初踏出太阳系，是出于科学的好奇心以及资源的探索。太阳系外观察不能的未知世界，科学高速发展带来资源的急速需求，都让探索太阳系外世界的呼声在联邦中日溢高涨。
最终，宇宙世纪元年，人类派出集合最新科技的宇宙飞船EV-1夏娃号，代表全人类的意志冲向太阳系外侧。
然而，这一切也成了祸端的根源。在人类踏出太阳系那一刻起，伴随着新世纪的到来，有别于人类的特异物种也登上历史舞台，那就是——怪兽。
没有理由、没有缘由、没有交流。几乎九成九的怪兽在遇到人类以后第一反应就是攻击。它们展现出明显的敌意和恶意，即使人类想要进行交流和对话也无济于事，反倒引得怪兽的攻击越发狠烈。
庞大的体形，堪比战舰的力量，违反物理和生物常识的身体结构。一切的一切都超出人类的想象，完全颠覆了人类在宇宙世纪以前的世界观。最初遇到怪兽的时候，人类连怪兽这一类存在都无法用科学解释，在未知和恐惧下人类最初战斗的很艰难。
更可怕的是，怪兽之间也有强弱之分，强大的怪兽甚至需要一个舰队才能消灭！哪怕是那些比较弱小的怪兽，也需要人类全副武装才可能消灭。
人类和怪兽的战争自宇宙世纪元年以来就从未停止过，最初入侵太阳系的怪兽大多只是实力弱小的先头兵，并没有引起人类的重视。但随着时间的流逝，入侵太阳系的怪兽强度越来越高，直到足以覆灭战舰队的超强怪兽出现时，人类才终于感到大事不妙。然而，为时已晚。
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