早在天启七年五月时，正值朱由校落水病重那段时间。
奴酋皇太极亲率十万八旗兵进攻宁远、锦州等地，时任辽东巡抚的袁崇焕和平辽总兵赵率教坐镇防守，爆发了历史上着名的“宁锦之战”。
明军凭借各级将领的冷静调度、辽东士卒力战不退，坚守城池。双方激战二十余天，建奴死伤惨重，损失万余人，皇太极被迫撤兵。明军取胜，史称“宁锦大捷”。
长期以来，建奴都是以“以战养战”的方式，通过战争来掠夺人口财富粮食、补充战略资源。而宁锦之战的失败，使得建奴不仅空手而归，未能获得补给，反而在战争中将存粮消耗一空，损失大量青壮人口。
此时又正值青黄不接之际，秋季未到，粮食未熟，导致东北地区爆发了一场前所未有的大饥荒。建奴内部，粮食价格飙升，一斗米竟然要价八两银子，有的地方有钱都买不到粮食。时间一长，家家易子相食，甚至互相杀戮，剖尸取肉。
在大饥荒的巨大压力下，皇太极等建奴高层不得不改变战略方针，寻找新的出路。
皇太极一方面积极笼络蒙古诸部，孤立察哈尔，一方面又对其采取军事行动。天启八年二月，皇太极率军在敖木伦击溃察哈尔所属的多罗特部落，俘获一万余人。九月又率满蒙联军进攻察哈尔部，大胜而归。
在击败察哈尔部控制了大凌河上游地区之后，建奴也就获得了绕开宁锦防线、直接威胁大明京师的基本条件。
天启九年春节，在爆竹声、烟火气中，大明百姓迎来了新年。
由于朝廷调度得当，这一年的冬天，京畿地区物资充足。京师更是取消了宵禁，允许商贩开门做生意，百姓上街游玩，燃放烟火。
这一晚，朱由校在御书房，批阅着奏章，身边坐着几人正吃着火锅。
朱由校手中拿着奏折，一旁的魏忠贤不时夹一块肉递到他嘴里，吃得满嘴流油，一脸满足。
朱由校放下奏折，一拍魏忠贤，道：“老狗，你也坐下来，吃！”
魏忠贤忙道：“老奴谢皇爷恩典！老奴身份卑微，不敢……”
朱由校一眼看向田尔耕，田尔耕心领神会，一把扶住魏忠贤，半请半拉把他按在皇帝旁边的座椅上，嬉皮笑脸道：“魏公公就不要推辞了，免得拂了陛下一番好意啊！”
于是一张大圆桌，桌上是一个铜鼎火锅，四周摆满各式丰盛的配菜。
皇帝居正首，左边是东厂提督太监魏忠贤、锦衣卫都指挥使田尔耕、西厂提督将军骆思恭，右边是内阁首辅韩爌、吏部尚书温体仁、东阁大学士刘鸿训，皇帝对面是户部尚书郭允厚、兵部尚书袁可立、工部尚书徐光启。
大明帝国中枢最举重若轻的十个人齐聚一桌。
朱由校把奏折递给韩爌：“各位爱卿都看看这折子，发表一下看法吧。”
韩爌看完大吃一惊，看向骆思恭，问道：“骆督主，折子上的情报所言能确认真伪吗？”
骆思恭肯定道：
“阁老无需怀疑。我西厂人员自前年九月就已经渗入辽东地区，监视鞑子的一举一动，至少每隔半个月就会有情报汇总传回。而自宁锦之战后，鞑子内部就闹起了饥荒，奴酋皇太极一直积极对外进行军事扩张和掠夺。去年初开始就一直在做兵力调度和物资储备，为进攻我大明做准备。”
袁可立看过折子后也认同道：
“去年建奴已经占据了义州以西、大凌河上游地区，蓟州镇边关各卫所也多有上报建奴、蒙元的探马出没日益频繁。如果建奴联合蒙元作为向导，就可以绕过宁锦，直接进军永平府、蓟州、昌平州一线，威逼京师！”
田尔耕叹道：“东北战事将至啊！”
朱由校点点头，道：“建奴狼子野心、虎视眈眈，蒙元残余也是亡我之心不死，国朝内忧外患，军务繁重，朕欲设一新官署，专为用兵而设，以处理紧急军务。”
“全凭陛下旨意。”
天启九年正月初五早朝，朱由校下旨设立“军机处”，全权总理全国军务，任命袁可立、秦良玉、魏云中、孙承宗、卢象升为军机大臣，任命郭允厚、徐光启、刘宗周、赵率教、孙元化为军机处司务。
军机处设置在御书房隔壁，方便随时协助皇帝处理政务。
正月初七，军机处下发多条军务指令：
一、设立“晋绥军指挥使司”，任命孙传庭为晋绥军指挥使、周遇吉为指挥同知，都督山西军务，整顿各卫所，组建晋绥军；
二、命黄得功率三千营自山西班师回京；
三、设立“关宁军指挥使司”，任命孙承宗为关宁军指挥使、袁崇焕为指挥同知、马世龙为指挥佥事，全面改组关宁军；
四、革除万全都指挥使司、山西行都指挥使司，设立“宣大军指挥使司”，任命李邦华为宣大军指挥使加兵部尚书衔、茅元仪为指挥同知、黄公辅为指挥佥事，都督宣府镇、大同镇军务，整顿各卫所，改组宣大军；
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