然而，几天下来，专案组还是一无所获。莫非陈宝新插上翅膀飞了不成？
专案组召开紧急会议，经对前期的工作情况进行认真反思，大家综合分析认为，陈宝新极有可能已逃往外省藏匿。
果不其然，10月10日，有一名群众到专案组反映：陈宝新现在已逃到了新疆。
情况反馈到专案组后，县委常委、县公安局长陈锋进、副局长陈国利等经紧急碰头磋商决定，虽然偌大一个新疆维吾尔族自治区，不知陈宝新躲藏在何处，但新疆一行还是值得一走。刑大副大队长兼重案中队中队长胡建忠主动请缨前往缉拿案犯，胡建忠有多年的公安实战经验，阅历丰富，他自信一定不虚此行。同时选派一名从小在新疆长大、会新疆话、懂新疆生活习惯的刑警一同前往。
次日上午，由胡建忠带领的一行四人即刻飞往新疆。到达新疆后，不说强烈的高原反应，单是饮食问题，就完全超乎刑警们的设想。办案人员无暇顾及大漠迷人的风光，克服常人难以想象的困难，即投入紧张的工作之中。
在当地公安机关的积极配合下，刑警们通过各种侦查手段，经过七天七夜的苦战，胡建忠等人终于查清了陈宝新租住在特克斯县的一个偏僻村落——第六公社里。
10月19日凌晨25分，特克斯公安局刑侦大队的刑警们和胡建忠等人一起将那个小村落团团包围住，成瓮中之鳖的陈宝新只得乖乖就擒。被抓后，陈宝新的第一句话就是，“真没想到你们会这么快抓到我，我服了！”
据犯罪嫌疑人陈宝新交代：
谷清荣原来是他朋友，住在两对门，1998年11月份他向谷清荣借了500元人民币，后为打联姻发生矛盾而没有将钱还给谷清荣。
1999年9月30日晚，他正和朋友在快餐店喝酒时，谷清荣带了好多人到其家中，为500元债务发生纠纷，谷清荣动手打了陈宝新，后被在场的朋友拉到楼上。过了一会儿，他听见楼下闹起来好凶，并听到有人说“人被打倒了”，即拿出平时藏匿的手榴弹，冲下楼去朝谷清荣头上砸去，接着引爆手榴弹，往谷清荣身边抛去。
陈宝新其实心里也十分害怕，爆炸时大脑一片空白。爆炸后，他后背受了弹片伤，但当时也顾不上那么多，当即租了一辆小四轮往瓯江大桥方向逃走，后又租车到了温州西站，再租车逃到瑞安，然后乘卧铺客车到达福州，最后，才在福州租了出租汽车一路往广州驶去。
然而到达广州后，在那里的表兄弟却不愿收留他。当时给了他一些钱后，叫他去别处停留。后来，他才辗转乘火车到达新疆，在其表兄弟的堂兄弟的帮助下，到距俄罗斯边境仅30公里的偏僻村落租房居住，再伺机逃往俄罗斯准备长期藏匿。
陈宝新说当时特害怕警车、警察，见到警报响起心里就特别紧张。他说，原本打算在北疆待几天，再等机会逃到俄罗斯，想不到竟会这么快就被抓住。陈宝新最后在看守所里无可奈何地摇了摇头。
1999年10月24日凌晨，经公安机关23个日夜的艰苦奋战，涉嫌爆炸犯罪的犯罪嫌疑人陈宝新被永嘉警方从新疆自治区距俄罗斯边境仅30公里的偏僻村落抓获归案并顺利押回永嘉。
至此，震惊全市的永嘉瓯北“9·30”军用手榴弹特大爆炸案终于成功告破。
2000年7月，经法院审理，陈宝新被依法判处死刑，其他几人也受到了法律的制裁。
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