第三新东京市警署
“您好，请问我可以看一下上次死徒事件的几名受害人的尸检报告吗？”真嗣取出自己的搜查员证件交给警方，刚才他推说要去德先生的咖啡店取昨晚放在那里的书，与明日香分别后独自一人来到了这里。
“请跟我来。”一名警员邀真嗣与他一同前往档案室。
档案室内，验尸官取出了死徒事件中的几名受害者的尸检报告交给真嗣查阅，真嗣先是简单浏览了一下理科教室内的几人的报告，发现那几个人的情况相似，然后他直接拿出了最上葵老师的报告看了起来，发现档案中多了一只证物袋，里面有一小撮金黄色的像是头发的丝线，看上去似乎是被用力扯断的。
“我们在对最上葵小姐进行尸检时发现，葵小姐右手的手心攥有这样一束可疑的毛发，经检验，这毛发属于一位人类女性。”验尸官回答说。
“这么说杀害最上葵老师的凶手另有其人！”真嗣对这个发现感到意外，却不是很吃惊，因为他一直觉得最上葵老师遇害案疑点重重，“温室就是最上葵老师的遇害现场，而知道那个地方的人只可能是校内人士，这束头发能够证明凶手是女性，而且从年龄上来看犯人很可能就是我们学校的人！”
“可问题是，我们把头发上提取的DNA上传至基因数据库，发现找不到与之匹配的人。”验尸官为难的说。
“这可就有点棘手了。”真嗣也觉得事情没那么简单，因为他们学校中有金色头发的师生廖廖无几，而且经过DNA比对后已经全都被排除了。
就在真嗣准备离开警署时，却发现外面的雨越下越大，已经形成了暴雨，地面上的积水也越来越厚，很快道路便成了一条条小河，完全无法步行打伞回家了。
“天气预报说最近两天会有台风经过。”旁边的警员看着这异常的天气说，“路上积水这么严重，看样子也无法用警车送你回去了，真嗣你就暂时先待在这里吧。”说着，他递给真嗣一杯热气腾腾的咖啡。
“谢谢。”真嗣接过咖啡后，来到一旁的椅子上一边休息，一边等着雨停。过了一会儿，他的手机响了，真嗣拿出手机一看，是明日香打来的。
“真嗣！大事不好了！”手机另一端传来明日香绝望的喊声，“地下商场被水淹了，我被困在里面了！”
“什么！？”真嗣一听，觉得事情远比想像的要严重。
“我们刚刚通知了消防署。”旁边的那名警员说，“大概十几分钟就能到了。”
“可是…”话虽这么说，可真嗣哪能放心呢？他急忙起身来到门口向外一看，眼前看到的景像着实把他吓了一跳，这雨已经大到不能用下雨来形容了，整个第三新东京市简直就像处在一个巨大的瀑布下面！地面上的积水已经漫到了台阶的最上端，已经跟洪水没什么两样了！
“我这边情况也好不到哪儿去！”面对这么严重的水灾，真嗣也无能为力。但是他突然想到，“对了，也许参森先生会有办法。”
阿姆斯特朗家别墅
“是吗，那麻烦了。”参森刚刚给绫波丽所住的医院通了电话，确定医院所受的影响不大便放心了，他刚挂上电话，紧接着就收到了真嗣的来电。
“喂，真嗣，你那边情况怎么样？什么！好，知道了。”一听说明日香被困在了地下商场里，参森于是决定亲自去把她救出来，他挂上电话，来到窗户边向外看了一眼，只见雨势比刚才更大了，仿佛天上的窗户敞开，大渊的泉源裂开一样，暴雨的规模简直能与挪亚方舟时代的大洪水有一拼！
参森转身下到别墅一楼，见罗杰和芙萝拉正在把一些重要的东西集中在一起，准备往二楼送，于是他告诉二人自己要去地下商场救明日香，叫他们把门窗都关严，不要为他担心。
“注意安全，少爷。”罗杰提醒参森。
“放心吧。”参森穿上了他平时一直穿的那件深绿色雨衣，打着赤脚朝城市的方向走去了。
那一天，第三新东京市遭遇了百年不遇的特大暴雨，城市内的排水系统虽然是目前世界上最先进的，可面对如此大规模的降雨还是力不从心。道路严重积水，交通瘫痪，市内多处地区断电，NERV本部更是被淋了个落汤鸡，所有人包括葛城美里和赤木律子在内都在想方设法排除险情。
中央作战司令部内
“紧急情况！玉川发生决堤！市内多条河道的水位均已高过警戒水位！”日向诚报告说。
“C区和D区严重积水，已经达到危险程度了！”青叶茂看着电脑屏幕上的数据说。
“立即将所有紧急排水闸门都打开！并通知救援队前去救援！”天城瞳命令道。
实验区内，伊吹摩耶正和赤木律子在紧急转移重要的文件和电子设备，确保它们不会被水淹，葛城美里则在通道内指挥工作人员堆砌沙袋和其它可以用的东西来阻断不断涌入的洪水。
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