肺的隔叶上有不同程度的硬化和肥大，小叶间结缔组织增生。
气管断面有不同黏度的渗出液。在肺泡和细支气管中，充满了大量的肺泡巨噬细胞、嗜中性粒细胞和多核细胞。
【诊断】
本病为急性传染病，仅靠流行病学、临床症状及病理变化只能做出初步诊断，确诊需要进行实验室检查，包括病原分离与鉴定、血清学试验和分子生物学技术。
1.病原分离
尼帕病毒在Vero、BHK、PS等细胞中生长良好，引起CPE，形成典型的合胞体，可从脑脊髓液、喉、鼻分泌物和尿中分离到病毒。
2.血清学试验
目前使用的有ELISA和血清中和试验等。
3.分子生物学技术
RT-PCR技术能特异性地扩增到N基因中的目的片段，可用于诊断。另外，还应用巢式RT-PCR技术。
【防控】
目前尚无特效治疗药物。
一旦发生本病，应立即封锁疫区，扑杀疫区内的患病动物及潜在受感染动物，并进行深埋或焚烧。
对疫区进行全面彻底的消毒，禁止疫区内动物向外运送，以防止疫情的蔓延。疫情控制后要加强监测。
我国目前无本病发生，因此应加强出入境检疫，防止该病传入我国。
【公共卫生】
人感染后潜伏期4d至2个月，一般为1～3周。
不同患者临床症状的严重程度不同，主要为发热、头痛、头晕、呕吐、嗜睡、意识混乱，几天后发展到昏迷不醒，并有1/3的病人会在昏睡中死亡，耐过者出现永久性脑损伤。
特征性临床症状包括节段性肌阵挛、高血压、心动过速、反射消失、肌张力低下。引起死亡的直接原因很可能是脑炎，尤其是当脑干受到影响时，病死率更高。也有部分人无临床症状，但血清学检测呈阳性。
隔离病人，防止交叉感染。治疗重点是加强护理、对症处理和防治并发症。据报道，使用利巴韦林(ribavirin)治疗可以降低死亡率。
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