至于那些沿海官军，遭遇动乱时，不管是不是倭，只要上报为“倭乱”，就可以把问题“政治化”，失败了容易推卸责任，赢了则奖赏更高。
而对于庙堂之上的统治者来说，将沿海民乱定义为外族入侵，将其极端仇视的海商力量与叛国者画上等号，镇压起来也更为便利与合理。
于是，一场因海禁而导致的海滨民众的抗争和叛乱，被民间、官府、朝廷几方各怀目的的共同虚构，完成了欺骗后人几百年的历史谎言。
嘉靖四十年（1561年），戚继光率戚家军等在台州九战九捷，歼入寇台州之敌。此后，戚、俞联合，基本肃清福建、浙江倭寇。
嘉靖四十四年（1565年），戚继光与俞大猷二军配合，击灭盘踞在广东、南澳的倭寇，至此，侵扰东南沿海多年的倭患，总算彻底解决了。
在朝廷强大的军事力量攻击下，东南沿海的倭患总算是彻底清除了。海面保持了相对的平静。但根本问题不解决，这种平静能保持多久？
其实答案很简单，只有解决了那些依靠海上贸易大批相关人员的生计，才是釜底抽薪的良策。
隆庆元年（1567年）明穆宗采纳福建巡抚涂泽民的建议，取消海禁，准许人民航海前往东洋、西洋贸易，从此民间私人的海外贸易获得了合法的地位，东南沿海各地的民间海外贸易进入了一个新时期。倭患骤然减少了，“倭渐不为患”。
从1567年到1644年这段时间，海外流入大明朝的白银总数大约为3亿3千万两，相当于当时全世界生产的白银总量的三分之一，这为大明帝国积累了巨大的财富。
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