工部负责统筹建设，船厂、码头、工坊、移民住房、道路等等，以后会慢慢放开民间建筑队，到时工部就可以只负责一下重点大工程，部长选定了梁斌
人口农业部负责移民安置、开荒屯田、人口发展、调配等等，同时出台了移民政策，耕种屯田前三年免佃租，第四年收1成、第五年收2成，以后维持两成佃租；如果家庭生育两个孩子减一成佃租，生育三个孩子佃租全免，所有土地属于黄煜，并禁止土地买卖；以后随着发展可以考虑拆分为民部和农业部；部长陈城
商部负责管理所有的商品买卖，包括工坊的生产、产品的销售、岛内所有商铺的管理，以后会调整为只负责商业规则的订立，政策的制定和研究，商业发展的调节；以后一般的商业活动可以开放给民间；部长辛家铭
教育部，顾名思义就是所有的教育问题，分为义务教育和技术工人的教育培养。部长李守宗
科技部目前以研究院为基础进行扩建，订立不同的研究方向，有黄煜提供技术资料以便指引方向，尽快提升台湾的科技水平；孙匠头已经不适合管理工作了，让他专业负责钢铁的研究，重新选择了部长郭文铭
军部，又分为参谋部、做战部、做训部、后勤部；参谋部负责制定作战计划，还有军队的发展研究，部长黄煜兼任，成员为林远清、梁大伟、蒋世有、王虎、滕锐等；作战部部长林远清，负责之行作战计划；作训部部长周进华，负责军队的招募训练；后勤部部长刘德山，负责管理兵工厂和部队装备，还有部队的后勤等工作。
各部门都搭起了架子，使管理更加的高效有序；随着船队的扩大，未来一段时间移民会爆发式增长，提前完成改革也方便以后的管理，这也是徐骥来到后的第一个建议，以前的管理有点太混乱了，各地管各地的，使得发展不均衡，也不适合统筹协调。
之后的时间黄煜彻底成了甩手掌柜的，管理的事全部交给了徐骥，自己轻松多了；他则是更多的时间待在科技部的研究院，跟随蒸汽机研究所一起，以一个现代人的思维提供一些想法，解决了他们很大的困扰，现在主要的问题是气密性和抖动太厉害，黄煜让他们尝试一下弹簧减震，但是气密性需要用到橡胶，看来下次回去需要搞来点橡胶树和橡胶草种子了，橡胶树成长周期长，需要几年培育，橡胶草的周期短，出产少点也没关系，短时间也够用；长期在重点发展橡胶树种植。
这半年时间，泉州船厂和台湾船厂，一共造出了1000料6艘、1500料3艘、2000料10艘，台湾船厂4个船坞造了4艘2000料战船，剩下6个船坞也已经建好，马上可以开始造船了，年底就可以再造出一批船，这样黄煜的船队实力将大大增强；台湾的造船厂不像泉州船厂一样，规划的船坞就比较大，能造2000-5000料的船，现在船厂的技术和工匠技术都不足，还早不出2000料以上的船，所以只能现在2000料的船，明年可以试着增加船的吨位。
给北上船队增加7艘2000料和1艘1500料的船，替换掉原来3艘的1000料船；这样北上船队一共有7艘2000料船，3艘1500料船共10艘船，也是黄煜手中最大的船队，负责向北方运送工坊出产的铁器、蒸馏酒，还有玻璃和糖等的物品进行销售，回来时带回打量的人口，每两个月可以完成一次来回。最近趁着北方女真占据辽阳、沈阳，要从北方接回打量流民。
海军方面增加了3艘2000料船、2艘1500料船，这样海军一共有10艘战船，等水手完成训练，装备火炮，就能形成战斗力了，明年荷兰人就要来了，先是进攻澳门失利，后抢占澎湖，进攻厦门，大明水师和荷兰在东南海域大战，最后大明水师战败，被摧毁战船和商船共七八十艘，伤亡1000余人，之后荷兰就彻底占领了澎湖和台湾，直到郑成功收服台湾，中间被荷兰人占领几十年。现在自己来了，台湾是自己的大本营，绝对不能让荷兰人来到自己家门口；虽然自己现在的海军战船吨位和人员素质都不占优，但是自己还有一年时间，一定要抓住这个机会。
北上船队替换下来的3艘1000料船，补充进了台湾往来泉州的台湾1号船队；也大大的增加了1号船队的运载能力，以方便东南方向的移民，和物资转运。
安排船只时想起的明年大明荷兰第一次海战，使黄煜的心情都有些沉重；决定先派遣一部分工部人员去澎湖，修建港口留作军港，在建一些炮台；不打无准备之仗，先准备好充分的准备，实在不行就把荷兰人到自己预设的战场，这一战自己必须胜利。
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