因为这本书已经毫无起色，毕竟是我的问题，也不能怪任何人在这里至少给个结尾，我会尽力写的非常详细，给一个好的结尾。
本书后半段的故事主要是主角寻找三圣之心的过程，他在这一部分要找尹瑞奥的原因，是因为尹瑞奥知道怎么进黑图书馆，而在抓走尹瑞奥，并离开后维托遭遇了尹瑞奥的“客户”
千疮之子的阿里曼，他与尹瑞奥达成了交易，他以庞大的代价从尹瑞奥手中买下黑图书馆中，据说可以将他的兄弟们，重新变回有意识状态的知识，阿里曼跳帮上船，要抓走尹瑞奥，但在此之前，维托为了掌握主动权，用最极端的方式，他利用莉莉丝埋在自己灵魂中的碎片，自己运用了色孽之力，吞噬了尹瑞奥的灵魂。
他得知了进入黑图书馆的方式，并且让阿里曼只能与自己合作，维托承诺帮助阿里曼，但前提是，他要帮自己先干一件事，打又打不过，别无选择阿里曼只能同意。
维托前往了科摩罗，协助玛勒丝策划一场针对维克特的政变，在此期间主角偶遇了可汗，他也来给暗精找茬所以相遇了，之后他们一起参与了科摩罗政变。
可汗带领白疤突然闯入，导致混乱，并让科兹用神瘟彻底杀死维克特，阿里曼也受到召唤前来，但令人意想不到的，马格努斯既然也一起来了，他们与可汗联手，杀光了血伶人协会的血伶人们。
马格努斯用自己的强大灵能彻底杀死了他们，让血伶人们无法复活，帮助维托完成了政变，但又被刺玛勒丝，导致她无法稳定局面，又因为没了血伶人，没人可以在复活，黑暗灵族之间的矛盾彻底爆发，陷入长时间的内战与混乱，从而无法威胁帝国。
主角后来会在维克特的宫殿里，找到前往黑图书馆的道路，并找到小丑，得知要得知三圣之心是什么，在黑图书馆中，主角遭遇了第二军团的基因原体，已死的哈里法斯，第二军团是波斯风格的军团，和千子差不多，崇尚知识，也导致他们触碰到了帝皇不允许的禁忌。
在这里，揭晓了第二军团被消灭的原因，哈里法斯在大远征期间获知了原体计划的真相，所有的原体都有这一部分亚空间的存在，就和书前半部分说的一样，这导致他们天然就极有可能被混沌污染，如雷霆战士一样，而帝皇知道，但还是创造了他们，并会在他们可能不可避免时空时杀了他们。
哈里法斯震惊不已，并发现帝皇为了掩盖这个谎言，杀死了所有喜马拉雅山基因实验室计划的成员，以及所有知道混沌秘密的永生者，除了维托，他想要将其真相告诉他的兄弟们，但却被帝皇发现，派遣黎曼鲁斯和维托将其杀死。
最终是维托砍下了他的头，两人见面意味深长，最终哈里法斯告诉了维托他的灵魂在死后，被小丑带走了具体原因，将其囚禁在了黑图书馆里，作为守护灵存在，小丑说是为了一场游戏，哈里法斯告诉了维托，要摧毁混沌并非不可能，在黑图书馆的漫长岁月中，哈里法斯发现了混沌虽然的能量体，但在漫长的信仰崇拜，以及神格化后，其实已经拥有了一个核心，也就是神格。
摧毁神格，就可以摧毁混沌诸神，虽然可能无法避免新的神明在漫长的岁月后诞生，但可以摧毁现在的这些，争取时间与和平。
带着这个重要的秘密，维托又得知，要找到三圣之心就必须去找尹莎，维托出来后后来与马格努斯长谈了一番，马格努斯表示，他要背叛奸奇，这没什么奇怪的，毕竟奸奇的信徒们嘛，不互相被刺还算奸奇信徒吗？
而不为维托所知的，在之前，小丑偷偷的找到了马格努斯，在科摩罗的废墟中告诉了他当年的真相，奸奇是如何利用他，以及现如今掌握了他一半灵魂，他从未获得过自由的命运，他自始至终，都是个玩偶。
这激怒了马格努斯，也让他下定决心，这一次，他会掌握自己的命运，无论是从帝皇手中，还是奸奇那儿，所以马格努斯与维托达成了秘密的盟约，而维托也如愿以偿的，帮助了阿里曼复苏了他的兄弟们，至此千疮之子加入元帅的队伍。
随后主角前往了纳垢魔域，与纳垢达成合作，后者不在进攻帝国并与主角缔结不情不愿的盟约，在此时刻主角离间了莫塔里安与纳垢的关系，随后在纳垢魔域的正中央，想办法开启了一扇通往其余三个神领域的大门，导致亚空间大混战。
主角将手中的神瘟子弹交给了莫塔里安，让他自己决定，是要真正掌握自己的命运，还是当一个提线木偶，无论是帝皇的还是纳垢的。
趁机救出了尹莎，并从她口中得知了三圣之心是古圣打造的圣器，其可以吸收与平衡实体宇宙，与亚空间之间的波涛，类似于中古大漩涡，它可以将帝皇的灵魂吸入其中，并囚禁于此不断地虚弱，禁锢住帝皇无法死去成神，并让主角有机会彻底击败他。
尹莎在告诉主角，要找到三圣之心的位置，首先要找到定位器后来就离开，前去统合如今破碎的方舟灵族，主角继续踏上冒险之旅，并在一系列的探险与走访后得知，定位器被珞珈拿着，随后主角计划前往珞珈处，夺来圣器。
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