开发周期长达两年半的《塞尔达传说64-时之笛》历尽磨难。卡带到64dd专用最后又改回为卡带，仅游戏使用的载体就一再更改。
在开发途中担任插画的石之森章太郎大师的不幸病逝也给宫本茂的心灵以极其沉重的打击。
在前世的那两年半的时间里是任天堂加入电子游戏产业以来最黯淡凄凉的时期，虽然N64的游戏种类和数量乏善可陈，社长山内溥对《塞尔达传说64》的一再延期并没有过多苛责，他深信只有开发出超越俗类的作品才能重新获得市场的认可，在1997年末接受日经新闻采访时山内宣称1998年圣诞将是决定胜负的转折点。
宫本茂对《塞尔达传说64》倾注了最大的心力，把洋笛作为贯穿剧情核心是源于偶然的灵感，他为此大胆地将原剧本推倒重来，直到98年初该作品才被正式定名为《塞尔达传说64-时之笛》。
在前世的1998年11月21日，岛国各地的电玩专卖店出现了久违的行列，成千上万的玩家急切地把期待已久的超大作捧回家中。
《塞尔达传说64-时之笛》再次上演了大作牵引主机销量的神话，N64的周销量由前周3千台以下的冰点急速跃升到15万台以上，这是该主机两年来第一次将pS主机踩着了脚下，此后凭借着《元气皮卡丘》、《邦乔与卡斯义》等作品的连携N64主机在1998年底掀起了相当成功的反攻浪潮，但是因为缺乏其他第三方厂商的通力协作，任天堂精心安排的一次战略大反攻最终在pS潮水般的软件阵容防御下宣告失败。
宫本茂曾经惋惜地说：“如果那时我们能得到哪怕一点的协助，可能未来的局势就会完全不同。“
《塞尔达传说64-时之笛》被誉为任天堂美学的代表产物，其完成度之高令同业者惊叹不已，一个世嘉家用软件开发部门的高层在接受岛国游戏批评访谈时由衷表示：“这样的游戏，如果是鄙社的话恐怕在半年前就用来上市销售了。“
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